自中国加入WTO以来，海关监管工作的主要矛盾主要体现在严密监管手段与快速通关时效不匹配。面对着迅速发展的对外贸易形势，海关的监管环境也面临着巨大的挑战和压力，在此情况下既要保证海关监管的严密性，又不能降低贸易通关的时效性，以往的海关监管方式已经很难做到。由此催生出海关稽查这样一种新的管理模式。海关稽查发展至今，已成为现如今世界上各个国家海关采用的，符合现代化贸易方式的海关监管手段。自20世纪90年代初中国海关建立海关稽查制度以来，现代化的海关稽查已初具规模，相关法律法规日益完善，职能和责任更加明确，工作形式不断丰富，其监管作用有效发挥。在维护海关职责范围内税收应收尽收，查处企业违法走私行为，优化海关监管等方面，海关稽查已成为海关现代化监督管理的重要手段并发挥着积极作用。在目前海关稽查执法程序下，执法监督的重点集中在事前的风险防控与事后的执法评估，而内嵌于稽查作业工作流程中的海关稽查执法审核工作却常常被忽略其重要职能作用，在稽查执法审核工作执行过程中仍存在明显问题，主要包括海关稽查执法审核工作法律制度不完善、操作程序不完善、岗位管理不完善、有效执法力量不足等四个方面的问题。究其原因，主要是海关稽查执法审核工作法律制度未及时修订，海关稽查执法审核工作作业模式与现行稽查作业模式脱节，海关稽查执法审核工作队伍管理不科学等方面造成的。2017年1月，国务院办公厅印发了《推行行政执法公示制度执法全过程记录制度重大执法决定法制审核制度试点工作方案》，将该项审核制度列为“三项制度”之一，海关稽查执法审核工作的重要作用也日益突出，现行的海关稽查执法审核工作已与海关稽查执法模式不匹配，因而有必要完善现行的海关稽查执法审核工作。本文以南京海关稽查执法审核工作现状为出发点，通过分析海关稽查审核工作的面临的问题及产生上述问题的原因，探究其通过完善海关稽查执法审核工作法律制度、优化海关稽查执法审核工作作业模式、加强海关稽查执法审核工作队伍建设等途径，对健全海关稽查执法审核工作制度，加强稽查执法事中监督，规范稽查执法行为具有深远意义。