随着经济、社会的快速发展，环境污染问题日趋严重。国外发达的国家已经将环境绩效审计作为环境管理的手段之一，但是我国目前仍然处在实现经济发展为第一要务的阶段，忽视了很多的环境问题，对环境绩效审计的实施则更少之又少。环境绩效审计发展为之缓慢，环境绩效审计研究体系不完善，评价指标的不健全，从而导致审计人员很难做出公正，客观的评价。本文在回顾总结国内外关于环境绩效审计方面研究的基础上，结合我国的实际国情，对企业环境绩效审计体系进行系统的分析；阐述了环境绩效审计体系的基本理论，并且在将平衡记分卡引入到环境绩效评价指标中，从财务角度，客户角度，内部环境管理角度，创新与学习角度四个方面设计企业环境绩效指标。由于环境绩效审计过程中很多指标难以量化，为了使其定性指标可以量化，本文采用数学模糊综合评价法对定性指标予以量化，从而使企业的环境绩效审计结果更为准确，为企业的可持续发展提供有用的信息。再通过一个具体案例，叙述开展环境绩效审计的过程，并对如何完善企业环境绩效审计的构建提出合理的建议。