近年来,伴随着国家医药业卫生体制改革的逐步深化,“营改增”、“两票”、药品“零加成”等制度的不断实施,医药制造行业迎来了大洗牌。面对这样的机遇与挑战的同时,提升企业内部管理水平,制定正确的企业绩效管理体系,引导企业围绕实施短中期战略目标而不断发展,是近年来各家医药企业越来越关注的焦点。因此,本文从东森医药有限公司（以下简称“东森医药公司”）的人力资源管理现状及现行绩效管理体系存在问题的研究入手,围绕实现企业发展战略目标导向,研究运用关键绩效指标KPI设计出一套有效的绩效评价指标体系,具有十分重要的意义。首先,本文研究了对论文的研究背景、研究问题和研究方法和思路进行了阐述,对关键绩效指标的概念、特点、评价过程进行了研究总结。其次,结合东森医药公司当前生产经营实际、人力资源管理现状、公司各层级的绩效考核现状等内容,归纳分析公司绩效考核的主要特点;通过调查问卷的方式,对员工对公司的绩效评价的满意度进行调查,对调查结果进行分析,得出东森医药公司绩效评价体系中存在的问题,提出解决这个问题的关键在于公司绩效考核制度的重新设计。再次,描述了基于KPI考核体系设计前的工作准备,对KPI指标设计中的要素进行了统一规范,对KPI指标设计的原则、思路进行了阐述,在此基础上,根据公司绩效评价现状,将公司战略目标层层分解落实,制定出企业、部门、员工等三级绩效评价指标体系,对基于KPI绩效评价体系进行优化设计。然后,根据绩效管理的流程要求,对公司实施过程中评估体系的业务流程进行了深入研究,对绩效准备、计划制定、绩效实施、考核反馈等绩效考核体系进行完善,将绩效考核结果充分应用于公司的薪酬管理、培训开发、评先评优等人力资源管理当中,并对新绩效指标体系的试运行过程中取得效果进行了介绍。最后,对研究成果进行简要的总结和展望。本文是基于关键绩效指标KPI而构建完整的绩效评价体系,运用该工具方法,将东森医药公司企业绩效考核中存在的弊端进行有效解决,将绩效考核实施与公司发展战略相适应,与员工绩效满意度相匹配。通过现有体系的实施,大大提高了东森医药公司的企业管理水平,对国内相关制药企业提升企业管理水平提供一些有用的参考。