面对越来越激烈的市场竞争，我国企业要在世界市场中拥有一席之地，必须首先要拥有自己的自主知识产权，否则，就无法建立起核心竞争优势，参与世界范围内的激烈竞争。企业若要建立核心竞争优势，就必须通过深入研发(research and development，R&D)，积极开发新产品、新技术与新工艺，建立持续竞争力，掌握竞争的主动权。与发达国家的跨国公司相比，我国的企业在研发上的投资总量和投资效益上都不具有优势，因此，这就更要求我国企业提高投资决策的水平，科学决策，提高投资效益。R&D项目投资具有不确定性、不可逆性和竞争性的特点。传统的投资决策方法与单一的实物期权方法已经不能满足对R&D项目投资决策的需要了。本文结合R&D项目的这些特性，应用博弈理论，对两个企业在自主研发与合作研发、自主研发与学习模仿之间选择的博弈问题进行了均衡分析，分别得到了相应的均衡策略，并对所获得的均衡策略进行了分析，提出了相应的管理方针；利用期权博弈理论与方法，研究了在自主研发模式下，企业如何在R&D项目投资过程中进行科学地决策的问题，得出了企业最优的投资临界点和投资时机。