阿尔兹海默病关键风险基因外周血白细胞DNA甲基化程度的临床对照研究

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【目的】研究外周血白细胞中AD关键风险基因BIN1、CX3CR1、CR1、SLC19A2、TNFRSF1B、PRCC的甲基化程度在病程中的改变:探讨DNA甲基化在AD疾病发展中的作用。【方法】纳入40例轻度认知功能障碍患者(MCI组)、40例阿尔兹海默病患者(AD组),选取性别、年龄、教育程度相匹配的29例正常对照者(NC组)。采用简易精神状态评定量表(Mini-mental State Examination,MMSE)、蒙特利认知评估量表(Montreal Cognitive Assessment,Mo CA)、日常生活能力量表(Activity Of Daily Living Scale,ADL)、神经精神科问卷(N-europsychiatric Inventory,NPI)、汉密顿抑郁量表(Hamilton Depression Scale,HAMD)、汉密顿焦虑量表(Hamilton Anxiety Scale,HAMA)评估受试者的神经认知功能和心理状态。采集受试者外周静脉血,提取外周血白细胞DNA,经重亚硫酸盐处理,在Illumina Hiseq平台进行高通量测序,对受试者BIN1、CX3CR1、CR1、SLC19A2、TNFRSF1B、PRCC基因位点的甲基化程度进行计算分析。采用独立样本T检验进行组间DNA甲基化程度的差异性分析,采用logistic回归分析对认知障碍的危险因素做多因素分析,对甲基化程度有统计学差异的Cp G位点计算ROC曲线下面积分析该位点甲基化程度用于筛查出MCI和AD患者的敏感性。【结果】1.CX3CR1、BIN1基因在外周血白细胞的总体甲基化程度相对较高(甲基化程度>0.1),CR1、SLC19A2、TNFRSF1B、PRCC基因的总体甲基化程度处于相对较低水平(甲基化程度<0.1)。2.比较目标基因总体甲基化程度在三组间的差异,CX3CR1、PRCC总体甲基化程度在认知障碍组和对照组间存在统计学差异(p<0.05)。3.比较外周血白细胞目标基因不同Cp G位点的甲基化程度在三组间的差异,MCI组与NC组间相比在以下位点存在差异(p<0.05):SLC19A2(30,57,64),NFRSF1B(73,199),PRCC(46,181,194),采用多元Logistic回归模型对入组病例的认知功能情况做多因素分析,结果显示SLC19A2(30,57,64),TNFRSF1B(73,199),PRCC(46,194)位点的DNA甲基化程度两组间对比均有差异(p<0.1);AD组与NC组间外周血白细胞DNA甲基化程度在以下位点存在差异(p<0.05):CX3CR1(42,51,64,71,85,125),CR1(106,108,112),TNFRSF1B(73,90),PRCC(125,181),采用多元Logistic回归模型对入组病例的认知功能情况做多因素分析,结果显示CX3CR1(42,51,64,71,85,125),CR1(106,108,112),TNFRSF1B(73,90),PRCC(125,181)位点的DNA甲基化程度两组间对比均有差异。4.ROC曲线分析结果提示:在诊断MCI患者方面,SLC19A264和TNFRSF1B199两个Cp G位点的甲基化程度检测具有较强的诊断敏感性(SLC19A264:AUC=0.671,p=0.017;TNFRSF1B73:AUC=0.648,p=0.040。);在诊断AD患者方面,CX3CR1125、CX3CR142、CX3CR151、CX3CR164、CX3CR171、CX3CR185、TNFRSF1B73、PRCC125、PRCC181等9个Cp G位点具有较强的诊断敏感性(CX3CR1125:AUC=0.723,p=0.02;CX3CR142:AUC=0.725,p=0.002;CX3CR151:AUC=0.720,p=0.003;CX3CR164:AUC=0.768,p<10-3;CX3CR171:AUC=0.758,p<10-3;CX3CR185:AUC=0.714,p=0.003;TNFRSF1B73:AUC=0.727,p=0.002;PRCC125:AUC=0.668,p=0.021)。(注:各基因后数字示该基因包含的甲基化位点在所处扩增子上的位置)。【结论】1、DNA甲基化改变可能调节AD风险基因的表达而影响AD的病理进展。2、外周血白细胞CX3CR1甲基化程度较高,且筛查AD的敏感性较好。3、外周血白细胞DNA甲基化程度可能是识别和诊断AD的生物学标志物,外周血CX3CR1甲基化程度可能作为筛查AD患者的候选生物标志物。
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