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本论文主要由HIV蛋白酶抑制剂的研究和开发以及SARS冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂的研究两部分组成。
抗艾滋病药物的研究有多个靶点目标，其中HIV蛋白酶为较为成熟的靶点蛋白。它在病毒复制过程中的主要机制是将gag和gag-pol基因产物裂解成病毒成熟所需要的结构蛋白和酶类。体内通过抑制这种酶的活性，其子代病毒仍会产生，但却是不成熟和不具传染性的。因此抑制HIV蛋白酶，可阻止病毒进一步感染。
本论文第二部分工作是SARS(severe acute respiratory syndrome，SARS)冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂的设计、合成。3CL蛋白酶是抗SARS药物研究的理想靶点。在此工作基础上，合成了肉桂硫胺及其盐酸盐，完成了3CL蛋白酶抑制活性及抗病毒活性的测试。另外，通过计算机模拟3CL蛋白酶三维结构模型与肉桂硫胺分子结合的研究，结合3CL蛋白酶抑制剂的设计的报道，我们设计合成了三大类50多个新化合物进行筛选。其中部分化合物显示了一定的蛋白酶抑制活性。特别是化合物181a比肉桂硫胺的抗病毒活性更强。