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放线菌是产生生物活性物质最多的一类微生物资源，迄今为止发现的22,500多种微生物活性产物中有70％以上是来自放线菌；已获应用的微生物活性物质不到1％，其中71％是放线菌产生的。因此，从放线菌中寻找新的活性物质是微生物资源开发利用的重要途径。从理论上讲，新物种应该具有新基因，从而合成新的产物。因此发现新菌种正是发现新化合物的必要前提。本研究通过对稀有放线菌分离方法和快速鉴别的研究，发掘新的放线菌资源，为寻找新的活性物质提供物种资源。
从云南昆明、西双版纳等地采集药用植物根际土样，通过比较不同分离培养基、土样预处理、孢子诱导、分散差速离心等方法，开展稀有放线菌分离方法的研究。研究结果表明：海藻糖．无机盐培养基综合分离效果最好，不仅稀有放线菌的出菌率高，而且种类丰富。虽然改良HVG培养基中稀有放线菌出菌率不是最高，但由于培养基中含有吉兰糖胶，对产孢放线菌的生长有促进，分离到了一些特殊类群，如：游动四孢菌属(Planotetraspora)和游动放线菌属(Actinoplanes)。研究发现：用酵母膏+SDS(十二烷基硫酸钠)溶液预处理土样，能促进放线菌孢子的萌发，不仅能有效地抑制了细菌，而且分离到的放线菌类群最丰富。用脱脂牛奶+MOPS(N—吗啉代-丙磺酸)溶液和角蛋白+MOPS溶液预处理土样，虽然出菌率比较低，但分离到了一些稀有的放线菌属如游动放线菌，游动四孢菌等。改良分散差速离心方法研究的结果显示：第二次离心的分离效果佳，其菌落的形态与第一次有明显的不同，稀有放线菌出菌率最高。
利用ARDRA(扩增rDNA限制酶片断长度多态分析)聚类分析法，探索快速鉴别方法，以期快速淘汰重复菌株选出代表菌。研究结果显示，用ARDRA分析法可快速有效地分辨属级差异的菌株，且菌株的颜色与酶切条带没有直接的相关性。
采用多相分类方法，对形态特殊的 YIM 45607，YIM 45681，YIM 45720，YIM 45721，YIM 45762，YIM 45725和YIM 45751等7株稀有放线菌，进行了细胞化学组分、16S rRNA基因序列相似性分析及其基因组DNA-DNA同源性测定等研究，发现5株放线菌新种。菌株YIM 45681为马杜拉放线菌属(Actinomadura)的1个新种，命名为白色马杜拉放线菌(Actinomadura alba sp.nov.)：菌株YIM45720为链霉菌属(Streptomyces)的一个新种，命名为慢生链霉菌(Streptomyces serianimatus sp.nov.)；菌株YIM 45721为小月菌属(Microlunatus)的一个新种，命名为橙黄色小月菌(Microlunatus aurantiacus sp.nov.)；菌株YIM 45725为多态放线菌属(Actinopolymorpha))的一个新种，命名为橙红多态放线菌(Actinopolymorpha rutilus sp.nov.)；菌株YIM 45751为斯氏菌属(Stackebrandtia)的一个新种，命名为黄白斯氏菌(Stackebrandtia flavoalba sp.nov.)。