肝细胞癌复发转移相关lncRNA-mRNA调控网络分析

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jonefarhua
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[背景]:肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)切除术后复发转移是影响术后患者生存及远期疗效的关键因素。最近的研究揭示了部分长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNA)在肿瘤发生发展中具有重要作用。然而,对于HCC复发转移相关lncRNA的研究相对较少。[方法]:我们分析了 GSE101432数据集中原发性HCC和复发性HCC患者的lncRNA和mRNA表达谱。将差异表达的lncRNA(DE lncRNA)和mRNA(DE mRNA)用于构建lncRNA-mRNA共表达网络。并对该数据集运用了 WGCNA分析,然后进行GO富集分析。最后,通过TCGA数据库对相关结果进行相关性分析和生存分析,并通过qRT-PCR的方法对生物信息学筛选的结果进行临床样本验证,最终筛选出在对HCC复发转移可能具有重要角色的lncRNA。[结果]:在这项研究中,鉴定了与HCC复发转移相关的lnRNA和mRNA。发现WGCNA中两个关键模块与肝癌的复发转移密切相关。lncRNA和及其共表达mRNA的GO分析结果也表明了它们与肝癌的复发转移密切相关。此外,我们验证了这些基因对HCC患者的总体生存期(OS)和无复发生存期(RFS)可能具有重要作用。最后我们总共识别并验证了 2个与HCC复发转移相关的lncRNA及其共表达的mRNA(LINC00941,LOX,MICB,OTX1)(LINC00668,BAIAP2L2,KCTD17,NDUFA4L2)。[结论]:通过研究,我们发现了可能与HCC复发转移相关的关键基因模块和中心基因,并构建了与此癌症类型相关的lncRNA-mRNA网络。这些结果为今后肝细胞癌复发转移的机制研究奠定了前期理论基础。
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