戊型肝炎(hepatitis E,HE)是一种由戊型肝炎病毒(hepatitis E virus, HEV)引起的严重危害人类健康的急性病毒性肝炎。已经证实HE是一种人兽共患传染病，中国是HE高发地区，新疆在20世纪80年代曾发生过大规模的人HE流行，而且疫情主要发生在少数民族比较集中的南疆地区。鲜见该病在新疆牛、羊群中发病的报道。本文为了进一步了解新疆地区目前HEV在牛、羊群中的流行情况，采用免疫组织化学染色方法对新疆6个县（市）的215头屠宰牛和新疆6个县（市）的258只羊肝脏中HEV抗原进行检测，并进行统计学分析。实验结果显示，牛、羊群HEV感染率分别为20.00%和14.73%。牛群HEV感染率最高的是吐鲁番地区，为28.33%，感染率最低是沙湾县，为8.00%，不同地区之间感染率差异显著(p<0.05)；3岁以上的牛肝脏HEV感染率要高于3岁年龄以下牛，各年龄段牛肝脏HEV感染率差异显著（P<0.05）；牛群各品种HEV在15.71%～18.00%之间，而且品种间感染率差异显著(p<0.05)；母牛感染率高于公牛。羊群HEV感染率最高是吐鲁番地区，为17.14%，最低的是米泉市为12.00%，不同地区之间差异不显著(p>0.05)；羊群3岁以上的羊肝脏HEV感染率明显高于2岁以下羊的肝脏HEV感染率，1岁羊肝脏HEV感染率与其它年龄段羊肝脏HEV感染率差异显著（P<0.05）；母羊的感染率同样也高于公羊的感染率。屠宰流水线采集牛羊肝脏150份和120份，制作的切片通过苏木精-伊红染色后进行了组织病理学观察。实验结果显示，52.00%的牛肝脏和42.70%的羊肝脏呈现淋巴细胞等炎性细胞浸润、肝细胞变性坏死、肝小叶周边带变性坏死、汇管区胆管增生、肝细胞萎缩、纤维结缔组织增生、胆管壁增生明显、中央静脉周围淋巴细胞浸润、肝窦内出血、肝小叶肝窦内水肿等不同程度病理变化。本文进一步证明新疆牛、羊群中普遍存在着HEV感染，而且检测结果与吐鲁番地区是人戊型肝炎流行的疫区相吻合；牛羊随年龄的增长其HEV感染率增加；在新疆饲养的不同品种牛、羊均对HEV易感，而且母牛羊HEV感染率高于公牛羊。