芯片重测序技术检测成骨不全基因突变体系的建立及其应用

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研究目的:成骨不全(Osteogenesis Imperfecta, OI)是一种十分罕见的骨骼系统疾病,以骨脆性增加为主要特征,又称脆骨病。大多数成骨不全患者是以常染色体显性方式遗传,少部分患者以常染色体隐性方式遗传。其中Col1a1和Col1a2上引起的突变导致常染色体显性遗传,而CRTAP,LEPRE1和FKBP10则引起常染色体隐性遗传。基因测序是一种重要的检测疾病的方法,但由于基因片段长,很难有效的检测,同时成本费用很高。本实验的目的是建立一种快速、有效且成本廉价的方法检测成骨不全突变基因。研究方法:我们采用CustomSeq Affymetrix Resequencing Array来对成骨不全的5个基因进行高通量重测序。提取14例成骨不全患者和85例对照样本的外周血DNA,采用长片段引物扩增DNA的方法扩增样本DNA。通过DNA片段化及标记,将扩增产物进行杂交、洗脱,然后扫描,通过GSEQ对扫描结果进行分析。采用Sanger测序法对扫描结果进行验证。研究结果:重测序结果的碱基检出率为96–98%,准确率可达99%以上,并且与Sanger测序的结果基本一致。在14例成骨不全患者中,13例患者都可以成功检测出致病基因突变,且都属于点突变。通过这项技术还成功检测出一例新发现的碱基突变。1例患者存在插入序列,但未能通过这项技术成功检出。以上所有突变在85例对照样本中都没有发现。研究结论:本实验成功建立了一种高通量,快速有效的芯片重测序技术平台,这项技术将来可以应用于对成骨不全患者进行大规模致病基因的检测与筛查。
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