目的:通过身体功能训练和传统体能训练的对比研究,了解传统体能训练和身体功能训练对大学生健康体适能和FMS得分的影响,找出两种体能训练方式的差异和对学生健康体适能和FMS得分的影响水平,为在高校开展身体功能训练提供一定的参考。方法:通过文献资料法、实验法、数理统计法,以身体功能训练与传统体能训练为自变量,以学生健康体适能指标和功能性动作筛查为因变量。选取南昌市某高校女大学生新生25名为实验对象,实验组15人,对照组10人。实验组采用身体功能训练的方法进行训练,对照组采用传统的体能训练方法进行训练,经过12周的训练,对比两个组学生的健康体适能指标（身高、体重、BMI、腰臀比、体脂、立定跳远、握力、仰卧起坐、跪姿俯卧撑、肺活量、坐位体前屈）;功能性动作筛查指标得分（深蹲、跨栏架步、直线弓步蹲、肩部灵活性、主动直膝抬腿、躯干稳定性俯卧撑、躯干旋转稳定）。并运用描述性分析、组间采用独立样本t检验、组内采用配对样本t检验等统计方法对实验结果进行分析。结果:（1）12周的实验干预后,实验组健康体适能指标中身体形态（体重、BMI、腰臀比、体脂）相比于实验前有非常显著性差异（P＜0.01）。实验组健康体适能中的身体素质（立定跳远、1min跪姿俯卧撑、肺活量、坐位体前屈）相比于实验前有非常显著性差异（P＜0.01）。12周的实验干预后,对照组健康体适能中身体形态（体重、体脂、BMI）相比于实验前有显著性差异（P＜0.05）。对照组健康体适能中立定跳远、握力、仰卧起坐、跪姿俯卧撑、肺活量相比于实验前有显著性差异（P＜0.05）。（2）12周的实验干预后,实验组功能性动作筛查,其中深蹲、跨栏架步、直线弓步蹲、躯干稳定性俯卧撑、躯干旋转稳定动作模式的评分相比于实验前具有显著性差异（P＜0.01）。12周的实验干预后,对照组功能性动作筛查,其中躯干稳定性俯卧撑、躯干旋转稳定动作模式相比于实验前具有显著性差异（P＜0.05）。（3）12周的实验干预后,健康体适能中体重、体脂百分比、腰臀比、立定跳远、俯卧撑、肺活量、坐位体前屈测试指标的改善效果实验组要优于对照组。12周的实验干预后,FMS得分中跨栏架步、直线弓步蹲、主动直膝抬腿以及最后的总得分实验组要优于对照组。结论:（1）身体功能训练对女大学生减轻体重、降低体脂百分、减少腰臀比、提高下肢肌肉力量、上肢肌肉耐力、肺活量、身体后侧柔韧性的效果要优于传统体能训练。（2）身体功能训练对FMS测试中的跨栏架步、直线弓步蹲、主动直膝抬腿动作得分的提升效果要好于传统体能训练,提示采用身体功能训练在提高学生下肢髋、膝、踝的灵活性与稳定性,增强躯干稳定性方面有积极的效果。（3）本研究的结果对于高校开设更多丰富的身体功能训练有一定的参考意义。