论文部分内容阅读
目的:1.研究膀胱癌组织与同一个体的配对的膀胱正常组织进行比较,检测中国汉族人群中膀胱癌的体细胞突变;2.对比研究非肌层浸润性膀胱癌组织(Non muscle invasive bladder cancer,NMIBC)与肌层浸润性膀胱癌(Muscle invasive bladder cancer,MIBC)组织基因突变差异,筛选出两者中存在差异的突变基因,建立中国汉族人群膀胱癌基因突变模型。方法:分别收集NMIBC、MIBC患者的新鲜膀胱组织样本各16例,每位患者膀胱癌组织及配对的正常膀胱黏膜组织各一份,约5ug/份,置于-80℃超低温冰箱冻存。应用第二代基因测序(next-generation sequencing,NGS)技术检测94种与膀胱癌相关的基因突变表达情况,并分析不同类型膀胱癌组织基因表达差异。结果:本研究发现32例膀胱癌组织中检测的所有基因中约60.6%(57/94)发生了突变,突变率较高基因为:KMT2D(34.38%)、FGFR3(31.25%)、ARID1A(15.63%)、ATM(15.63%)、AKT1(12.50%)、DCHS2(12.50%)、LRP1B(12.50%)、STAG2(12.50%)、EP300(9.38%)、BRCA2(9.38%)。NMIBC中突变率最高的基因为KMT2D(50.00%)、FGFR3(50.00%)、ARID1A(31.25%)、ATM(18.75%)、STAG2(18.75%);MIBC中突变率较高的基因为KMT2D(18.75%)、CACNA1D(18.75%)、CREBBP(18.75%)、FGFR3(12.50%)、CCND1(12.50%)、LRRC7(12.50%)、TP53(12.50%)、OBSCN(12.50%)。NMIBC、MIBC二者共同突变的基因有14种,另外24种基因突变只出现在MIBC组织中,如:CACNA1D(18.75%);CREBBP(18.75%);CCND1(12.50%);LRRC7(12.50%);OBSCN(12.50%);RANBP2(12.50%);TP53(12.50%);VCAN(12.50%);APC(6.25%);ATR(6.25%);CCND3(6.25%);FOXQ1(6.25%);INADL(6.25%);JAK1(6.25%);KLF5(6.25%);MDM2(6.25%);MSH2(6.25%);MYC(6.25%);PCDHA9(6.25%);PDZD2(6.25%);PPARG(6.25%);RICTOR(6.25%);RPTOR(6.25%);ZKSCAN3(6.25%)。结论:1.首次在中国汉族人群中筛选出NMIBC、MIBC之间的突变差异。2.首次在中国汉族人群膀胱尿路上皮癌中检测OBSCNL、LRRC7、OBSCNL、LRRC7、MYC,PCDHA9基因突变,但这些基因与膀胱尿路上皮癌的关系有待进一步验证。3.MIBC的突变率明显高于NMIBC。