葡萄WRKY和VQ基因家族的全基因组鉴定、表达分析及蛋白互作预测

来源 :南京农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:neusoftlyh
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
葡萄(Vitis vinifera L.)是一种主要的经济作物,世界产量达到7亿吨,收获面积超过700百万公顷。葡萄种植主要用于鲜食葡萄、葡萄汁、葡萄干和葡萄酒生产。然而在果树的栽培过程中,经常会遭遇病害、干旱、低温和土壤盐渍化等逆境胁迫,严重影响了葡萄的生长发育。研究表明,WRKY转录因子在植物应对生物及非生物胁迫反应,调控胁迫相关功能基因的表达,提高植物的抗逆性中起着重要的作用。本研究从葡萄品种‘黑比诺’(PN40024)中克隆了两个WRKY基因,即VvWRKY21和VvWRKY30,并通过转化拟南芥验证了这两个基因的功能。主要研究结果如下:1、通过对葡萄基因组和蛋白组数据库的分析共识别59个WRKY基因,根据WRKY基因家族的结构特点和系统进化树分析,将其分为三个亚家族:Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ。染色体定位和基因复制分析表明,片段复制在葡萄WRKY基因家族的扩增中起重要作用。基于内含子-外显子结构分析,将WRKY结构域的内含子分为两种类型:V型和R型。基序分析表明同一亚家族基因成员存在相似的基因结构。通过基因芯片数据分析了葡萄WRKY基因在不同器官、组织及发育阶段的表达模式。利用实时荧光定量PCR方法分析了葡萄WRKY基因在干旱、白粉病侵染、水杨酸和乙烯处理下的表达模式。2、从12x葡萄基因组中共鉴定出18个VQ蛋白。根据系统进化树结构将其分为7个亚家族。对18个葡萄VQ基因的内含子-外显子结构和基序分布进行了研究。除VvVQ3和VvVQ17外,葡萄VQ基因都不含内含子。通过对拟南芥和葡萄共线性区域分析得出4个葡萄VQ基因和5个拟南芥VQ基因存在共线性。在葡萄VQ基因启动子区域主要有四大类型顺序作用元件:光响应元件、激素响应元件、响应外界环境胁迫和参与植物发育的元件。利用实时荧光定量PCR方法分析了葡萄VQ基因的表达水平。葡萄VQ基因在各种组织和发育阶段显示出组织特异性和组织优先表达模式。大部分葡萄VQ基因在干旱处理下的转录水平增加,这表明VvVQ基因在葡萄防御水分胁迫中发挥重要作用。在白粉病接种,水杨酸和乙烯处理下,葡萄VQ基因都有不同水平的表达。3、根据拟南芥WRKY蛋白和VQ蛋白的互作数据,利用直系同源基因的方法在葡萄中预测得到15对假定的WRKY-VQ互作蛋白。大部分互作蛋白之间有相似的表达趋势,特别是VvWRKY22/VvVQ5和VvWRKY03/VvVQ5。同时我们计算了葡萄WRKY-VQ互作蛋白在植物不同组织、器官及发育阶段的芯片表达数据的皮尔逊相关系数。VvVQ2和VvWRKY03,VvVQ5和VvVQ22互作蛋白的表达水平显著相关,表明这两对互作蛋白在功能上更加保守。4、从葡萄品种‘黑比诺’(PN40024)中克隆了VvWRKY21和VvWRKY30基因,VvWRKY21基因编码框长度为1011bp,编码337个氨基酸,VvWRKY30基因编码框长度为837bp,编码279个氨基酸。同时构建了VvWRKY21基因和VvWRKY30基因植物过表达载体,并利用蘸花法将VvWRKY21基因和VvWRKY30基因转入拟南芥,对转基因拟南芥进行了非生物胁迫抗性分析。结果表明:转VvWRKY21基因的拟南芥对ABA敏感,在干旱处理下,转基因株系表现出明显的抗性。在盐胁迫处理下,转基因株系不耐盐。转VvWRKY30基因的拟南芥对ABA敏感,转基因株系对盐胁迫有明显的抗性。
其他文献
在学习型社会中,信息素养成为最基本的生产要素。随着教育信息化的发展,对教师和学生信息素养的研究也越来越多。培养和提高高职院校教师信息素养是促进教师专业化建设的需要
目的对棘白菌素类抗真菌药物与机体固有免疫系统的协同作用机制进行探讨和综述。方法通过查阅文献,综述了近年来国内外讨论棘白菌素类药物对宿主机体免疫系统影响的研究,并按
工业设计概论作为工业设计专业的专业理论课,其教学方式方法的研究对课程的教学效果尤为重要。文章针对工业设计概论课程教学当下面临的新挑战进行分析、总结,就教学内容、教
<正> 没有高深学历、没有政治背景,硬是凭着一腔热血、硬是抱着实现自身价值的梦想,在1992年,这个世纪的春天里&#39;下海&#39;的晁宝中,面对瞬息万变的市场、面对硝烟弥漫的
期刊
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
个人所得税工薪所得起征点的调整涉及面广,影响深远。既关系到职工个人收入和消费也关系到一国内需和经济增长。本文从个人所得税两大职能角度出发,分析了我国个人所得税工薪
目的:在基层社区医院开展医院感染现患率调查,探讨开展现患率调查对实际院感工作的指导意义。方法:对住院患者进行现患率调查,对调查结果进行汇总、分析。结果:通过调查数据显示
本文采用实证研究的方法,探讨了内隐学习理论对高校体育院系背向滑步推铅球教学效果的影响。结果表明:以内隐学习理论指导教学,其效果优于传统的常规教学法,学生对所学的技术
基于PBL的"教学做合一"深度教学是一种新的教学尝试,本文是以问题为驱动,"教学做合一"为理论基础的课堂实践探究教学。实现高效课堂深度教学需要注重以下两点,一是设计富有启