新疆野苹果(Malus sieversii)又称塞威氏苹果,是重要的种质资源,属于国家二级保护渐危种。该种有多种优良性状,遗传多样性十分丰富,但其种下类型的分类问题一直不明晰,对该种下类型进行分类研究将为科学开发和利用该资源奠定基础。本研究以新疆野苹果种下类型为研究对象,采用核型分析的方法对分类进行研究,并利用SSR分子标记技术构建DNA指纹图谱,为进一步完善新疆野生苹果种质资源分类提供科学依据,进而为其开发利用奠定基础。主要研究结果如下:(1)以新疆野苹果不同种下类型幼嫩的茎尖为试验材料采用改进的适合新疆野苹果的染色体制片方法,对该种下类型进行核型特征研究。结果显示:新疆野苹果24个种下类型均为二倍体(2n=2x=34)染色体相对长度平均为3.23μm,属小染色体。染色体的平均臂比1.27-1.56之间,核型不对称系数范围为56.01%-63.39%。核型类型大部分为1A和1B型,个别为2A和2B;1A、1B、2A、2B所占的比例分别为41.67%、37.5%、8.33%和12.50%。从染色体长度观察,除了香酸野苹果和长柄红霞果以外,其他的类型均含有不同数目的长染色体(L)、中长染色体(M2)、中短染色体(M1)以及短染色体(s)等4种类型,没有发现随体。(2)根据新疆野苹果24个不同种下类型核型特征指标进行聚类,24个种下类型分为3类,第一类包括9个种下类型,它们具有较高的核型特征相似性,大多数类型的平均臂比大于其他类型,其进化趋势比别的类群较高;第二类包括11个,核型类型大多数为1B、2A、2B;第三类4个类型,平均臂比和核型不对称系数最小,核型类型属于1A和1B,说明该类群遗传相对稳定。(3)基于SSR分子标记对62份新疆苹果资源进行指纹图谱构建,从12对引物中选出鉴别能力最强的4对特征引物(CH03d07、MS06g03、CH02a08、CH02b12),应用引物组合法构建DNA指纹图谱,其中CH02a08标记区分效果最好,可将25个供试材料区分开;将4对引物进行组合,可将62个供试材料完全区分开,并按照SSR图谱的特异性标记位点,在遗传相似系数0.62处可将62个供试材料分为四大类群。(4)结合核型特征及分子标记图谱,对新疆野苹果种下类型进行分析。24个种下类型核型特征有一定差异,与传统分类方法比较,其揭示的种下类型之间的亲缘关系更加明晰,聚类结果更能反映出类型之间的一致性与差异性。按照SSR图谱的特异性标记位点,在遗传相似系数0.45处可将24个供试材料分为3大类群。根据两种方法揭示的信息,24个种下类型根据分子标记聚类结果和核型分析聚类结果进行比对,发现13个种下类型所在的分支具有一致性,表示这两种聚类方法出来的结果基本上接近,但其他11个种下类型划分结果并不一致。