我国创新驱动战略的提出使研发创新越发受到关注,企业作为市场主体,更需承担起研发创新的主要任务。由于我国各地区企业创新能力与研发水平存在明显不均衡,尤其是西部地区相对较弱,为缩小东西部创新水平差距,我国各项补贴政策也有针对性的向西部地区倾斜。新疆作为“一带一路”倡议中的核心区和对口援疆的受援地,是我国补贴政策集中实施地区,目前,国内外就政府补贴对企业创新的研究较丰富,但对西部地区尤其是新疆这一补贴政策叠加实施地区的研究较欠缺。目前,学术界普遍认可政府补贴对创新具有重要影响,但多是对研发投入的考察或认为补贴直接作用于创新产出,忽视了以“过程的眼光”细化补贴影响企业创新的复杂过程。为此,以新疆为典型地区,研究细化后的政府补贴对新疆企业创新能力的影响具有重要的理论意义与实践价值。本研究在梳理现有文献基础上,从现有研究的薄弱之处入手,将政府补贴对创新的影响细化为两个过程,分析作用机理,借助AMOS软件验证政府补贴的实际作用路径。之后,采用门槛面板模型进行实证研究,发现政府补贴在对创新产出、研发投入及研发投入转化为创新产出过程中发挥的作用呈现出复杂的非线性关系,进一步结合对典型案例的分析,指出新疆企业在利用补贴与创新方面存在的问题,并结合相关结论尝试提出政策建议,为合理制定与实施补贴政策、切实提高新疆企业创新水平提供借鉴。基于以上分析,本研究得出的主要结论如下:第一,政府补贴对新疆企业创新产出并无显著影响;第二,政府补贴对研发投入呈现显著激励作用,但存在单一门槛,当补贴水平超过门槛值后激励作用消失;第三,在较低的补贴水平下,研发投入的增加反而会抑制创新产出,而在较高水平的补贴条件下,研发投入对创新产出无显著影响;第四,企业异质性方面,企业规模与产权性质会带来政府补贴实施效果的差异,而企业生命周期对此并无显著影响。