一个国家的高等教育发展程度与该国的综合国力、社会经济发展水平密切相关,同时,高等教育还肩负着培养专门人才、科学研究、服务社会三大职能和任务。为此,世界各国不断努力发展高等教育,扩大招生规模。我国的高等教育也在高速发展,并颇见成效,诸如资源投入的增加和教育规模的扩大等。然而,高等教育在发展同时还伴随着高等教育资源不足、资源利用率低下、资源分配不均衡等不良现象。许多高校虽然规模和投入较大,但产出和资源利用率不高。在当前高等教育研究的基础上,本文对14所内蒙古地区本科院校教育资源利用效率进行研究。本文首先通过文献分析,分别对DEA方法和高等教育效率进行理论概述,并对DEA方法运用于高等教育效率评价领域作了初步介绍。然后结合内蒙古高等教育的实际情况,将数据包络分析(DEA)方法用于内蒙古地区本科教育投入产出的效率分析,试图对内蒙古地区本科教育进行DEA效率测度。在研究中系统把握了内蒙古地区本科教育资源投入的原则、主体、客体、以及方式,并在此基础上收集了原始数据,建立了相对科学合理的输入输出指标体系,得出了评价结果,针对内蒙古地区本科院校相对全国高等院校效率较低的现象提出了改进的意见。本文丰富了高等教育领域的评价方法体系。为未来内蒙古高等教育的办学提供可行的理论,为其发展提供了决策参考。