保守的Paf1复合物是一个多功能的复合物。在酵母中由Paf1, Ctr9, Leo1,Cdc73和Rtf1组成,而人源Paf1复合物还包括Ski8。在转录延伸过程中,Paf1复合物与活性基因的启动子和编码区相联系。Cdc73和Rtf1对Paf1复合物与染色质之间的联系是必需的。此外,Paf1复合物与FACT, Spt4-Spt5和TFIIS之间的相互作用也能够调节Paf1复合物向染色质的募集过程。Paf1复合物除了在转录延伸过程中的功能,它还能够促进转录相关的组蛋白修饰,包括H2B的单泛素化和组蛋白H3的甲基化过程。Paf1复合物能够募集泛素结合酶-连接酶复合物Brel/Rad6,而Brel/Rad6能够催化H2B的单泛素化过程,H2B的单泛素化又是甲基转移酶Setl/COMPASS和Dotl分别介导H3K4和H3K79甲基化的先决条件。此外,各种研究发现Paf1复合物还参与到其他各种过程中,包括RNA3’-末端形成的转录后事件,胚胎干细胞的维持,哺乳动物胚胎发育及疾病状态和癌症的发展的免疫反应。目前,Paf1复合物自身的装配过程及其行使功能的分子机制都是不清楚的。在本论文中,我们在体外实验中确定了Paf1与Leo1之间的相互作用,并确定了Paf1和Leo1中各自的最小结合片段。我们解析了人源Paf1复合物中Pafl/Leol亚复合物的结构,其分辨率为2.5A。结构分析显示Paf1和Leo1亚基之间的反平行β-折叠片层是两者之间的主要相互作用,并介导形成了紧密结合的Pafl/Leol异源二聚体。缺失突变及免疫共沉淀实验表明Leo1亚基通过Pai1结合Pai1复合物,Ctr9支架蛋白是Pai1复合物组装过程中的关键亚基。此外,我们证明了Pafl/Leol异源二聚体对其在体外特异性识别组蛋白H3,组蛋白八聚体和核小体是必要的。我们的研究结果揭示了Pai1复合物的组装过程和Pai1复合物介导的组蛋白修饰中的底物识别过程。