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[目的]本研究通过对干细胞移植患者与正常对照者之间粪便菌群种类及特异菌群的定量研究,了解干细胞移植患者肠道菌群结构差异及数量的变化,并探讨干细胞移植患者是否出现肠道细菌结构紊乱从而引起院内感染。[方法]本研究为前瞻性,观察性研究。根据入选标准,纳入复旦大学附属华东医院血液科进行干细胞移植的患者,收集患者干细胞移植前7-10天、干细胞移植后7-10天,干细胞移植后发生感染时的粪便标本。另外收集20个正常人的粪便标本作为对照。根据细菌的16SrDNA基因序列设计大肠埃希菌、粪肠球菌属、乳酸杆菌属、及拟杆菌属的引物,运用实时荧光定量-聚合酶链反应法(RT-PCR)定量检测两组患者中这四种细菌的数量变化。[结果]经RT-PCR对大肠埃希菌、肠球菌属、乳酸杆菌属、拟杆菌属定量检测后发现：1.HSCT患者3组相比：造血干细胞移植后发生感染时、干细胞移植前7-10天及干细胞移植后7-10天相比,粪便中3种细菌(大肠埃希菌、肠球菌属、和乳酸杆菌属)数量增多,其变化量分别为大肠埃希菌8.66±2.65 vs 8.55±1.1l vs 7.97±0.49, p=0.735；肠球菌属7.47±1.75 vs 6.70±1.76 vs 7.09±1.54, p=0.14:乳酸杆菌9.03±0.29 vs 7.57±0.28 vs 8.69±0.19 p=0.009.而在造血干细胞移植后7-10天,患者肠道中拟杆菌属数量增加,与造血干细胞移植后发生感染时及干细胞移植前7-10天相比,分别为6.74±0.19 vs 6.58±0.28 vs 6.67±0.24, p=0.964。2.造血干细胞移植后发生感染时肠道细菌数量较对照组增加,分别为大肠埃希菌8.66±2.65 vs 8.51±0.54,p=0.795,肠球菌属7.47±1.75 vs7.11±1.06,p=0.000,乳酸杆菌属9.03±0.29 vs 8.67±0.43,p=0.72,拟杆菌属6.67±0.24 vs 6.66±0.28,p=0.243。与对照组相比,造血干细胞移植前7-10天患者肠道中大肠埃希菌及粪球菌属数量下降,分别为7.97±0.49vs 8.51±0.54,p=0.417；7.09±1.54 vs 7.11±1.06,p=0.580。而乳酸杆菌属及拟杆菌属数量增多,分别为8.69±0.19 vs 8.67±0.43,p=0.954；6.74±0.19vs 6.66±0.28,p=0.85.3. HSCT患者3个采样点比较,只有乳酸杆菌属数量有显著差异(p=0.009),其他菌种之间无显著差异(p>0.05)。而造血干细胞移植后发生感染时与对照组相比,4种细菌都有所增加,分别为大肠埃希菌8.66±2.65 vs 8.51±0.54,肠球菌属7.47±1.75 vs 7.11±1.06,乳酸杆菌属9.03±0.29 vs 8.67±0.43和拟杆菌属6.67±0.24 vs6.66±0.28),但只有肠球菌属的差异具有统计学意义(p=0.000)。4.造血干细胞移植前7-10天大便菌群数量总体较对照组有所下降,但只乳酸杆菌属的差异具有统计学意义(p=0.002)。[结论]1.与对照组相比,造血干细胞移植后发生感染时肠道细菌明显增多。当造血干细胞移植后发生感染时肠道细菌结构发生改变。2.当造血干细胞移植后发生感染时肠道细菌结构发生改变,主要为肠道兼性厌氧细菌,其中以乳酸杆菌属及大肠埃希菌最为显著。3. Real-time PCR方法检测粪便中细菌DNA能反映肠道细菌改变。