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牡丹和芍药分属于芍药科(芍药属)的牡丹组与芍药组,都是世界上著名的观赏花卉。牡丹组和芍药组之间的远缘杂交开创了该属植物育种的新领域,组间杂种被誉为“牡丹和芍药的未来”将在很长一段时间内成为芍药属植物育种的主要发展方向之一。远缘杂交成功的关键之一在于合理的亲本选择,因此开展芍药属种质资源的亲缘关系研究工作,对育种工作具有现实指导价值。本研究从表型性状、ISSR分子标记两个方面对芍药属的47份材料进行了亲缘关系研究,以期为合理利用资源,开展远缘杂交工作提供参考资料,主要结果如下:1.从47份芍药属的种和品种中选取30个表型性状进行研究。R聚类分析表明,所选表型性状合理,可以用于个体间的分析;Q聚类分析和主坐标分析均可以将47份材料分成两大类三组:7份芍药组的材料单独聚为一类一组,14份组间杂种与26份牡丹组的材料聚为另一类两组(14份组间杂种聚为一组,26份牡丹组的材料聚为第二组)。组间杂种与牡丹组具有更近的亲缘关系,两者与芍药组的亲缘关系相对较远。2.利用优化的ISSR-PCR反应体系对47份芍药属的种和品种进行了指纹图谱分析。结果表明,47份材料被分成两大类三组:7份芍药、14份组间杂种和牡丹品种‘金帝’、‘芳纪’聚为一类(7份芍药聚为一组,14份组间杂种、牡丹品种‘金帝’、‘芳纪’聚为另一组),除‘金帝’、‘芳纪’之外的24份牡丹聚为另一类。结果表明,组间杂种与芍药具有更近的亲缘关系。3.芍药属47份种和品种的表型性状分析和ISSR标记分析的结果并不完全吻合,表型性状分析表明组间杂种与牡丹组的亲缘关系更近,而ISSR标记分析表明组间杂种与芍药组的亲缘关系更近,充分证实了组间杂种是牡丹组和芍药组的杂交后代。针对表型性状水平和分子水平研究结果不相吻合的现象,建议在本研究的基础上,结合其它分子标记的技术及DNA测序技术综合进行研究,以进一步探讨组间杂种在芍药属中的位置。