【摘 要】
：
目的:综合分析GEO和TCGA数据库中的乳腺癌数据,探求环状RNA、微小RNA和信使RNA差异的表达,构建乳腺癌竞争内源性RNA网络,识别并预测其功能。方法:1.从挑选出的数据中得到患者的随访生存信息以及相对应的乳腺癌和癌旁组织的基因表达数据、样本。2.其次利用差异分析得到癌组织和癌旁组织之间所有差异表达的基因,以差异基因和miRcode,miRDB等数据库为基础,构建出ceRNA网络。3.随后利
论文部分内容阅读
目的:综合分析GEO和TCGA数据库中的乳腺癌数据,探求环状RNA、微小RNA和信使RNA差异的表达,构建乳腺癌竞争内源性RNA网络,识别并预测其功能。方法:1.从挑选出的数据中得到患者的随访生存信息以及相对应的乳腺癌和癌旁组织的基因表达数据、样本。2.其次利用差异分析得到癌组织和癌旁组织之间所有差异表达的基因,以差异基因和miRcode,miRDB等数据库为基础,构建出ceRNA网络。3.随后利用DAVID数据库对差异表达的基因进行富集分析,探究该网络涉及的细胞成分、生物学过程、分子功能和信号通路。4.最后通过生存分析研究ceRNA中的各关键网络节点与乳腺癌患者OS（总生存率）之间的联系。结果:1.筛选出差异表达的circRNA、miRNAs和mRNA,包含1个circRNA、3个miRNA、68个靶mRNA的乳腺癌特异性ceRNA调控网络被成功构建。2.基于ceRNA网络中的基因进行生存分析,单因素COX回归和K-M回归结果表明有2个RNA的高表达与乳腺癌患者的总生存期长相关:hsa-miR-651-3p,RAB39B。1个RNA的高表达与乳腺癌患者的总生存期短相关:SLC6A4。3.本研究构建了一个由 hsacirc0059457,hsa-miR-651-3p,RAB39B,SLC6A4构成的预后相关ceRNA网络。结论:1.本研究构建了与乳腺癌预后相关的ceRNA调控网络,本网络包含了 hsa-miR-651-3p、RAB39B、SLC6A4。2.本研究为乳腺癌的发生、发展及预后提供了研究基础,为未来的进一步研究提供了方向。
其他文献
目的:1、LCN2对卵巢癌A2780细胞的增殖、迁移、侵袭以及凋亡的影响;2、探讨LNC2是否通过Notch信号通路对卵巢癌A2780细胞进行恶性生物学行为的调节。方法:1、获取和培养卵巢癌A2780细胞,设计引物构建si-LCN2、si-NC质粒,根据各组间的差别将细胞设置分组:si-LCN2组（实验组）、si-NC组（空质粒组）、Control组（空白对照组）。2、使用qRT-PCR实验检测三
目的:退休意味着工作角色地位、职业依恋、日常活动等的变化,退休与认知功能的变化息息相关。因此,本研究通过对长沙地区退休老人日常活动调查及其对认知功能的影响,寻求有利于退休老人认知功能的日常生活活动,以致于更好的指导老年人退休后生活方式,从而延缓痴呆的及认知障碍的发生发展,为政府部门提升社区养老服务能力和探索老年痴呆防治特色服务工作提供理论依据。研究方法:招募2021年1月-2021年10月参加我院
目的:对膝骨关节炎的全膝关节置换术中使用间隙平衡器（Offset Repo-Tensor）进行内外侧间隙平衡的联合组与使用传统经验法进行内外侧间隙平衡的传统组的两组患者进行术后早期疗效对比,从而探讨在测量截骨法的全膝关节置换术中使用间隙平衡器进行内外侧间隙平衡是否更具有优越性。方法:选取2020年10月至2021年8月在永州市中心医院冷水滩院区关节骨病运动医学科行全膝关节置换术治疗的46例膝关节骨
目的:1、GOLPH3（高尔基磷蛋白3,Golgi phosphoprotein 3）对胶质母细胞瘤U251细胞恶性生物学行为的影响;2、探讨GOLPH3是否通过RAS/MAPK信号通路调控胶质母细胞瘤U251细胞的恶性生物学行为。方法:1、体外培养胶质母细胞瘤U251细胞株,构建三组不同细胞株,其中一组含si-GOLPH3质粒（实验组）,另一组含si-NC质粒（阴性对照组）,第三组不做任何处理为
目的:通过检测HIF-1α和β-catenin在人胃腺癌组织和正常胃黏膜组织中的表达情况,分析两者之间的相关性及与胃腺癌不同临床病理参数之间的关联性,以期为胃腺癌的治疗提供更多的理论依据。方法:（1）随机选取42例经病理组织学检查确诊为胃腺癌并经手术切除的患者标本为实验组,且术前未经过放疗、化疗及靶向治疗等;收集同期在门诊就诊的志愿者正常胃黏膜组织42例为对照组;（2）采用免疫组织化学法和West
目的:一是发现颈动脉斑块形成的潜在危险因素,为临床早期合理控制危险因素以延缓颈动脉斑块的发生与进展提供参考,期望进一步降低T2DM的心脑血管并发症发生的风险性,二是了解影响T2DM患者血尿酸（SUA）水平的主要因素,提高临床医生对T2DM合并不同SUA水平人群的认识,为后续进一步研究提供理论基础。方法:选取2018年01月01日至2021年12月31日在永州市中心医院代谢内分泌科住院治疗的T2DM
目的:对比功能性扩张咽成形术（FEP）与悬雍垂腭咽成形术（UPPP）对于治疗重度阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者的疗效。方法:选取南华大学附属娄底医院耳鼻咽喉头颈外科2020年1月至2021年6月期间收治的行持续7小时以上有效多导睡眠监测提示呼吸暂停低通气指数（AHI）＞30次/h,并符合纳入与排除标准的阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者58例,按自愿原则行悬雍垂腭咽成形术者分为UPPP组（n=
目的:1.探讨CD24对人乳腺癌MDA-MB-231细胞增殖、迁移、侵袭、凋亡的影响。2.探讨CD24是否通过Wnt/β-catenin信号通路调控乳腺癌MDA-MB-231细胞的恶性生物学行为。方法:1.通过质粒转染构建CD24表达上调的MDA-MB-231细胞株;实验分为三组,CD24转染组和转染空白质粒的阴性对照组（NC组）以及未做转染的空白组（Control组）。2.采用Western b
目的:本课题拟通过非靶向代谢组学（LC-MS/MS）探索高危型人乳头瘤病毒（HR-HPV）阳性女性及健康对照女性宫颈管分泌物所含代谢物,寻找两组间的差异代谢物及其与HR-HPV感染的关系,分析其可能涉及的信号转导通路,为减少HR-HPV感染提供一种思路。方法:选取2020年12月至2021年09月就诊于广东省第二人民医院妇科门诊及体检中心,符合纳入标准和排除标准的育龄期女性40例作为研究对象。根据
目的:1.比较单孔加一腹腔镜手术（single-incision plus one port laparoscopic surgery,SILS+1）与传统腹腔镜手术（Conventional Laparoscopic Surgery,CLS）在右半结肠癌根治术中的围手术期指标。2.探讨将SILS+1应用于右半结肠癌根治术中的安全性及可行性。方法:通过采取回顾性分析的方法,收集了2019年1月到2