对湖南省日本血吸虫DNA多态性进行研究，旨在阐明湖南省日本血吸虫种内的遗传变异，为进一步的分子遗传学和分子诊断学研究奠定基础。采用PCR扩增、克隆、测序和序列分析等方法对湖南省日本血吸虫核糖体DNA(rDNA)内转录间隔区(ITS)序列、线粒体(mtDNA)NADH脱氢酶亚单位Ⅳ基因(nad4)和细胞色素c氧化酶笫Ⅰ亚基(cox1)序列的多态性进行研究。结果表明：1．首次在国内报道湖南省长沙及岳阳钱粮湖农场日本血吸虫ITS序列，其中日本血吸虫ITS-1全序列的报道是国际上首次。与GenBanK中收录的日本血吸虫部分ITS-1及ITS-2全序列做比较，发现它们之间有一定差异。2．nad4基因序列的PCR扩增引物是作者根据GenBanK中收录的日本血吸虫与肝片吸虫的nad4基因序列设计的一对兼并引物，扩增片段为500bp左右。日本血吸虫nad4基因序列的报道在国内是首次。不同的代表性样品nad4序列差异明显，碱基差异在1.0％～2.9％之间。3．cox1基因序列分析表明，采自湖南岳阳君山、岳阳汨罗的样品cox1序列之间有一定差异，碱基差异在0.2％～1.2％之间。 本研究证明了ITS、nad4及cox1三段序列确为理想的种内变异研究的遗传标记，研究结果有助于日本血吸虫的生活史、传播途径、流行病学、种群遗传学的研究和其相关疾病的诊断。