超级增强子调控基因编码蛋白EFNA1和MMP13在食管鳞癌患者血清中的表达水平及其临床意义

来源 :汕头大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hs20081987
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
食管癌是我国高发恶性肿瘤之一,主要包括鳞癌和腺癌两种病理类型,我国以鳞癌为主。虽然,近年来对食管癌的诊断与治疗取得了较好进展,但由于缺乏早期诊断手段,大多数患者在就诊时已处于中晚期,这是导致食管癌的总体生存率仍然没有明显改善的主要原因。因此,寻找血清分子标志物,提高食管癌的早期诊断率是改善食管癌预后的有效途径。
  首先,我们通过对前期利用染色质免疫共沉淀技术(ChIP-seq)鉴定出来的超级增强子相关基因进行编码蛋白表达定位分析,筛选出16个具有差异表达的超级增强子调控的编码基因分泌蛋白。通过肿瘤细胞系百科全书(CCLE)、GEO公共数据集和TCGA数据库,分析这些蛋白在食管鳞癌中的表达水平及其预后作用。通过ELISA实验小样本验证其在食管鳞癌患者血清中的表达。最后,我们筛选出EFNA1和MMP13作为食管鳞癌潜在的诊断标志物。
  再者,我们应用ELISA实验对血清EFNA1和MMP13在食管鳞癌的诊断价值进行了大样本、多中心验证。研究共纳入了576名受试者,其中汕头大学医学院附属肿瘤医院的345例受试者作为训练组,中山大学附属肿瘤医院的231例受试者作为验证组。结果表明,两组中的食管鳞癌患者血清EFNA1和MMP13的表达水平均显著高于正常对照者(P<0.05)。进一步的ROC曲线分析显示,训练组中EFNA1联合MMP13在食管鳞癌和早期食管鳞癌的诊断曲线下面积(AUC)、敏感度和特异度分别为0.809/54.0%/90.5%和0.797/51.1%/90.5%。在验证组中,EFNA1联合MMP13诊断食管鳞癌、早期食管鳞癌的AUC、敏感度和特异度分别为0.806/42.6%/89.4%和0.831/48.1%/89.4%。这些结果表明EFNA1联合MMP13对食管鳞癌具有较好的早期诊断效能。
  另外,我们分析了87例食管鳞癌患者手术前、后血清EFNA1和MMP13的表达水平变化情况。结果发现,在手术治疗后血清EFNA1和MMP13的表达水平均显著下降(P<0.001),提示血清EFNA1和MMP13是食管鳞癌疗效监测的潜在标志物。
  最后,我们运用MTS和划痕实验,分析siRNA瞬时敲降食管癌细胞(KYSE30)中EFNA1和MMP13表达对细胞增殖和移动能力的影响。结果发现,敲降EFNA1和MMP13可以显著降低食管鳞癌细胞的增殖和移动能力。
  综上所述,我们通过联合应用表观遗传学、RNA测序和生物信息学分析等手段,筛选出2种新的食管鳞癌血清标志物;在此基础上,应用大样本、多中心研究证实了EFNA1联合MMP13对食管鳞癌具有早期诊断价值。以上结果表明,EFNA1和MMP13联合检测是食管鳞癌早期诊断的潜在分子标志物,但将来仍需在更大样本、多中心的前瞻性实验数据中进行系统的研究与验证。另一方面,敲降EFNA1和MMP13可以显著降低食管鳞癌细胞增殖和移动能力,表明EFNA1和MMP13可能在食管鳞癌的发生发展中发挥重要作用,接下来将就其功能与分子作用机制开展研究。
其他文献
期刊
报纸
期刊
学位
期刊
目的  血小板(Platelet, PLT)输注是治疗PLT减少症,特别是重度的PLT减少症的最主要、最有效的治疗方法。PLT输注可以迅速提升患者的PLT的数量并减轻PLT减少带来的负面影响。因此,PLT输注的治疗价值在临床上是其它药物不能替代的。然而,一些患者在PLT输注后未达到预期的PLT计数增加。现在普遍认为影响PLT输注效果主要是病人的个体因素以及多次输注PLT而导致,较少研究是从所输注的
学位
前列腺癌是发生在前列腺的恶性肿瘤。大多数前列腺癌患者疾病进展缓慢,早期症状不明显,部分患者进展为晚期前列腺癌,发生转移和出现雄激素抵抗现象,严重者威胁到中老年男性的生命健康。对晚期进展性前列腺癌的分选一个前列腺癌的巨大挑战。尽管前列腺癌在欧美等西方国家中是有着很高的发病率,但在亚洲地区(如中国,日本等国家)发病率并不高,而随着中国人口的快速增长和社会经济的发展,前列腺的筛查及诊断水平不断提高,生活
学位
学位
手足口病是一种病毒性传播疾病,以手、脚、腹股沟和臀部的斑丘疹或水疱为特征,并伴有口腔溃疡性疼痛的儿童易患疾病,主要是由肠道病毒引起,以EV-A71、柯萨奇病毒A16(CV-A16)为主。目前上市的手足口病疫苗仅有EV-A71灭活疫苗,尚未见EV-A71黏膜免疫疫苗以及其它型别肠道病毒疫苗问世。黏膜是病原侵入的重要门户,EV-A71、CV-A16等手足口病患儿的排泄物、口鼻分泌物、唾液及疱疹液等带毒
学位
背景:  抗生素耐药是二十一世纪最严重的公共卫生问题之一,抗生素的广谱耐药对人类的健康及生态环境已构成了潜在的威胁。抗生素的过度使用或滥用是导致耐药性扩散的主要原因。耐药细菌、医疗废物中的抗生素以及患者体内残留的抗生素,均可排入医院污水系统,因此,医院污水因富集大量的细菌和抗生素在耐药细菌和抗性基因传播中起着重要作用。然而,国内对医院污水中的细菌种类和抗性基因研究还相对较少,因此对医院污水中的细菌
学位