胸苷酸合成酶基因多态性与儿童急性白血病易感性及HD-MTX毒副作用的相关性

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目的:研究胸苷酸合成酶基因(TYMS)编码区开放阅读框(ORF)及3’端非翻译区(3’-UTR)多态性在急性白血病(AL)儿童和正常儿童中的等位基因频率和基因型分布特征,分析其与中国汉族儿童AL发生风险即易感性的关系。回顾性统计分析大剂量甲氨蝶呤(HD-MTX)在治疗儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)时的毒副作用发生情况,分析ALL儿童TYMS多态性与HD-MTX引起的毒副作用之间的相关性。方法:采用RT-PCR-变性梯度凝胶电泳(DGGE)结合DNA直接测序技术,检测108例AL儿童和121例正常对照儿童的TYMS ORF和3’-UTR多态性及基因突变,分析其等位基因频率及各基因型在两组人群中的分布,并进行病例、对照优势比分析以研究TYMS各多态性与AL发生之间的关系。108例AL儿童中有85例ALL,后者有52例接受了HD-MTX治疗,按照美国国立癌症研究所的第3版常规毒性判定标准(NCICTCAE, version3.0)对患儿用药前后的一般反应、皮肤黏膜损害、骨髓抑制等临床表现和血尿常规、肝肾功能、心肌酶、心电图等进行回顾性统计,并分析HD-MTX毒副作用与各TYMS多态性之间的关系。结果:1.在中国汉族儿童TYMS ORF中仅筛查到2个单核苷酸多态性(SNP),分别为A381G和T349C。TYMS A381G(Glu127Glu)在AL患儿及正常对照儿童中的等位基因频率分别为13.0%和12.4%,等位基因频率在两组中差异无显著性意义(P>0.05),提示其与AL易感性无相关性。此外,在中国正常人群中确定了T349C(Phe117Leu)的存在及其等位基因频率为1.2%。2.在中国汉族儿童TYMS3’-UTR检测到2个SNP(C1100T、A1170G)和1494del6/ins6。AL组和对照组儿童TYMS C1100T位点CC、CT、TT基因型频率分别为10.2%、40.7%、49.1%和12.8%、37.6%、49.6%,C和T等位基因频率为30.6%、69.4%和31.6%、68.4%;A1170G位点AA、AG、GG基因型频率分别为47.2%、38.0%、14.8%和41.9%、42.7%、15.4%,A和G等位基因频率为66.2%、33.8%和63.2%、36.8%;1494del6/ins6多态性+6bp/+6bp、+6bp/-6bp、-6bp/-6bp基因型频率分别为8.3%、44.5%、47.2%和7.8%、42.2%、50.0%,+6bp和-6bp等位基因频率为30.6%、69.4%和28.9%、71.1%。此3个TYMS多态性的基因型和等位基因频率在两组间的分布差异无统计学意义(P>0.05)。3.连锁不平衡及单倍型频率分析发现,TYMS C1100T、A1170G和1494del6/ins6多态性之间均存在连锁不平衡(P<10-4),其中尤以C1100T位点和1494del6/ins6连锁不平衡最强。对预期发生频率高的四种单倍型进行分析发现,它们在AL组和对照组中的分布无显著性差异(P>0.05)。4.对75例ALL儿童的TYMS各多态性与临床特征如年龄、性别、危险度等进行分析发现,TYMSA1170G与ALL儿童性别相关,与AA基因型相比,携带等位基因G者男孩数约是女孩的3倍(OR=3.05,95%CI=1.14~8.19, P=0.023)。TYMS A381G、C1100T和1494del6/ins6多态性与ALL儿童的临床特征之间无相关性(P>0.05)。5.对52例接受HD-MTX化疗的ALL儿童毒副反应统计分析发现,骨髓抑制出现较广泛,发生率为92.3%;肝功能损害为40.4%;消化道反应为32.7%;口腔黏膜损害25.0%;心脏毒性11.5%,这些毒副反应大部分较轻微。6. TYMS A1170G的基因型与中性粒细胞减少的发生相关,GG基因型具有保护作用,其使中性粒细胞减少的发生危险降低(OR=0.07,95%CI=0.01~0.64,P=0.026)。A381G、C1100T和1494del6/ins6多态性与HD-MTX的毒副作用均无相关性(P>0.05)。结论:1.本研究对108例AL儿童和121例正常对照儿童共计229例中国儿童TYMS ORF的多态性及基因突变筛查仅检测到2个SNP(A381G和T349C),确定了它们在AL患儿及正常对照儿童中的等位基因频率及基因型分布。TYMSA381G与AL发生风险可能不相关;据我们所知,首次确定了中国人群TYMS存在T349C多态位点及其等位基因频率,此SNP的功能及与AL的相关性尚需扩大样本量或功能分析的进一步研究。2.本研究确定了TYMS3’-UTR的3个多态性位点C1100T、A1170G和1494del6/ins6在此次研究的中国汉族AL儿童中的分布特征,并发现C1100T和1494del6/ins6之间存在强连锁不平衡;这3个TYMS多态性与中国汉族儿童AL的发生无明显关联。3. TYMS A1170G多态性可能与ALL儿童性别相关。4. HD-MTX治疗儿童ALL时毒副作用较为常见,但多轻微,其中不同程度的骨髓抑制和肝功能损害最为常见,其次消化道反应、口腔黏膜损害等,大部分患儿对这些毒副作用可耐受。5. TYMS A1170G多态性可能与ALL儿童的HD-MTX毒副作用相关,1170GG基因型可能降低MTX导致的中性粒细胞减少的发生危险。
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