【摘 要】
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目的:利用目标芯片捕获高通量测序和Sanger测序,对一个少汗型外胚层发育不良家系进行遗传学研究;并对突变后的蛋白进行预测,分析其致病性。方法:收集该家系成员的相关临床资料,分析少汗型外胚层发育不良在该家系中的遗传模式。采集先证者、另外5名家庭成员的静脉血,提取其中的基因组DNA。先证者的基因组DNA使用涵盖541个与遗传性皮肤病密切相关的基因的目标芯片将目标基因捕获下来,然后采用高通量测序技术锁
【基金项目】
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山西省科学基金应用基础青年面上项目“PAR1基因通过调控肠道菌群缬氨酸代谢失活PPAR-α通路促进慢性自发性荨麻疹发病的机制研究（编号:201901D211489）”；
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目的:利用目标芯片捕获高通量测序和Sanger测序,对一个少汗型外胚层发育不良家系进行遗传学研究;并对突变后的蛋白进行预测,分析其致病性。方法:收集该家系成员的相关临床资料,分析少汗型外胚层发育不良在该家系中的遗传模式。采集先证者、另外5名家庭成员的静脉血,提取其中的基因组DNA。先证者的基因组DNA使用涵盖541个与遗传性皮肤病密切相关的基因的目标芯片将目标基因捕获下来,然后采用高通量测序技术锁定致病基因。先证者、其他5名家庭成员的基因组DNA,使用PCR技术扩增后,利用Sanger测序进行验证。使用Clusta软件分析突变序列的保守性;利用Uniprot网站查询突变基因编码的蛋白质结构、功能;PyMOL（三维分子模型软件）分析突变后的蛋白结构。结果:该家系共检出2名患者,均为男性;1名女性携带者,遗传模式符合X连锁隐性遗传。高通量测序结果显示先证者EDA基因8号外显子存在一个新的移码突变（NM001399:c.1077dupG:p.K359fs）。Sanger 测序结果证实了先证者 EDA 基因存在半合子突变;先证者母亲的EDA基因中也检出该突变,为杂合子。另一名患者为先证者的舅舅,其EDA基因中也存在相同的半合子突变。在先证者的父亲和正常人群中未发现该突变基因。突变位点在多个物种间高度保守。根据PyMOL（三维分子模型软件）分析,突变的EDA蛋白比野生型蛋白少了 6个β折叠,这使其与野生型蛋白的结构发生了明显变化。突变位点位于TNF同源结构域,突变可能导致蛋白失去与受体结合的功能。结论:该家系3代共8名成员,其中2名患者,基因检测诊断为少汗型外胚层发育不良;EDA基因c.1077dupG突变可能是导致该家系成员外胚层发育不良的致病突变,这个案例扩展了我们对XLHED突变谱的认识。
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