成人急性淋巴细胞白血病基因组拷贝数变异分析

被引量 : 0次 | 上传用户:suzengbiao
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究目的:研究成人急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia, ALL)基因组拷贝数变异(copy number variation, CNV)及杂合性缺失(loss of heterozygosity, LOH)。研究方法:应用Affymetrix人类基因组SNP6.0芯片检测成人ALL患者基因组拷贝数变异。利用生物信息技术构建基于KEGG数据库的Signal-Net,富集拷贝数变异的疾病相关基因。采用荧光原位杂交(FISH)技术对DCZF1基因拷贝数变异进行验证。结果:研究发现,与正常对照相比成人Ph+B-ALL最常见的CNV扩增区域在13q,缺失区域在6号染色体,LOH区域在17p; Ph’B-ALL最常见的CNV扩增区域在7号染色体,缺失区域在9p, LOH区域在15q、T-ALL最常见的CNV扩增区域在20号染色体,缺失区域在X染色体,LOH区域在9p。拷贝数变异区覆盖了很多ALL相关基因,如KZF1、JAK2、CDKN2A/2B、ETV6等。通过构建Signal-Net发现EGFR拷贝数扩增和IKBKG拷贝数缺失可能在B-ALL、T-ALL起重要作用。经FISH验证发现,在成人ALL中KZF1基因存在重现性的拷贝数扩增。结论:SNP Array是检测成人ALL拷贝数变异及杂合性缺失的重要手段,灵敏度高,可重复性好。成人ALL基因组拷贝数变异分析对发现疾病相关基因,指导疾病分组及治疗具有一定意义。研究目的:检测IKZF1基因在成人急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia, ALL)患者骨髓细胞中的表达亚型,分析IK6功能缺陷亚型患者的临床特征及预后。初步探讨IK6过表达对Nalm-6细胞系JAK-STAT信号通路的影响。研究方法:应用巢式RT-PCR方法检测79例初诊ALL患者KZF1基因表达亚型;统计IK6亚型阳性患者比例;分析IK6阳性患者年龄、性别、白细胞计数、融合基因、危险分层特点;比较IK6阳性组与IK6阴性组患者总生存率、无病生存率的差异。构建表达质粒pcDNA3.1-IK6,通过脂质体转染技术将表达质粒导入Nalm-6细胞系,使IK6基因过表达,采用PCR-Array及Western blot方法检测过表达IK6对Nalm-6细胞系JAK-STAT信号通路的影响。结果:在ALL患者中检测到IKZF1基因表达的功能亚型为IK1、IK2/3,功能缺陷亚型主要为IK4、IK6、IK8、IK9;表达IK6亚型患者占B-ALL患者的34.4%,占T-ALL患者的22.2%。B-ALL中IK6阳性组患者BCR/ABL1阳性率及高危组患者比例均高于IK6阴性组(P=0.027,P=0.048),而两组的年龄、性别、白细胞计数无显著性差异:T-ALL中IK6阳性组与IK6阴性组的年龄、性别、白细胞计数、危险分层均无显著性差异。在Ph染色体阴性的B-ALL患者中,IK6阳性组的总生存时间和无病生存时间均低于IK6阴性组(P=0.009,P=0.002)。PCR-Array检测IK6过表达的Nalm-6细胞中与JAK-STAT相关的11个基因表达上调(IFNR、IL4、MCL1等),2个基因表达下调(FAS、A2M)。Western blot显示IK6过表达的Nalm-6细胞中STAT3.Erkl/2磷酸化水平增高,对JAK-STAT信号通路具有激活作用。结论:在成人ALL中IKZF1基因IK6表达亚型为主要功能缺陷亚型,且与患者预后密切相关。检测IK6亚型在成人ALL的表达,可作为临床评估预后的参考指标。JAK-STAT信号通路激活可能是IK6阳性患者预后不良的重要机制。
其他文献
21世纪初,中国电力体制改革和国有资产监管体制改革的深化,给电力行业带来了新的挑战。大型发电企业若想在新的挑战和竞争中获得生存与发展,加强自身的管理是关键之举。管理
采购是企业经营管理过程中的一个非常重要的环节,经济全球化迅速发展的今天,不断快速变化的商业环境也让人们对采购的认识发生了根本性的变化。采购是公司战略决策中不可或缺
发电企业是提供社会发展动力的基础产业,近几年,南方由于遭受雨雪冰冻灾害、四川地震而引起的大范围停电所产生的后果再次强有力说明,电力生产安全关系到国计民生,关系到社会
如何处理经济社会发展与环境保护之间的关系,自人类意识到环境保护的重要性以来对此一直争论不休。这两者是生态经济的主体,它们之间的关系是生态经济的核心。在地处三江源的
当今世界是一个非均衡发展的世界,政府在其中扮演着非常重要的角色。从目前我国的现代化发展进程来看,政府决定着我国社会的发展方式、速度和水平,所以政府权威是我国现代化进程
改革开放以来,中国经济快速发展,开放程度不断提高。国内一批经济实力雄厚、外向度高的沿海城市和省会城市纷纷提出了建设国际化城市的战略目标。特别是国际金融危机以来,世
城市空间形态随着城市的发展而演变,它是不同历史时期城市社会、城市经济和文化的综合体现,同时也是自然环境因素和人类活动之间相互作用的综合结果,近年来,我国处于一个经济高速
在一个全球多媒体的信息时代,中国的电视正在进行一场深刻的变革。在一系列推陈出新的举措中,电视相亲节目再度成为电视荧屏的“新宠”。2010年以来,先后有数十家省级卫视纷
质谱成像(IMS)技术是将质谱检测与影像技术相结合,用于生物体内的内源性或外源性分子的原位分析与相对定量可视化检测的新型分子成像技术,已成为质谱的前沿领域和研究热点。
为了提高计算效率,针对结构动力时程分析中由时间步长引起的误差,建立了时间步长与相对误差之间的关系式,实现了满足目标误差限的时间步自动调整,丰富了时间自适应理论。通过