水稻是我国最重要的粮食作物之一,随着人们生活水平的提高,稻米品质受到越来越多人的关注。稻米品质分为外观品质、加工品质、蒸煮食味品质和营养品质,其中外观品质决定稻米的商品价值,而垩白是稻米最重要的外观品质之一。因此,稻米垩白性状的研究是稻米品质改良的最关键问题。本研究利用粳稻低垩白材料水晶3号和高垩白材料拉木加进行杂交,利用其F2分离群体进行极端性状混池重测序(QTL-seq),初步定位控制垩白的区间,同时利用24份垩白粒率呈梯度变化的粳稻材料,进行灌浆期籽粒转录组测序(RNA-seq),筛选与垩白粒率显著相关的基因,结合极端性状混池重测序(QTL-seq)结果联合分析定位候选基因。主要结果如下:1、垩白性状是由多基因控制的数量性状,低垩白调控基因呈隐性遗传,且垩白具有母体效应。2、水稻开花后14天,种子中心部位开始出现透明状淀粉颗粒,说明水稻胚乳淀粉积累是从米粒的中心部分开始,再逐渐向米粒的四周扩展,籽粒垩白部分在花后14-21天期间形成。3、通过极端性状混池重测序(QTL-seq),在海南F2群体中共检测到控制垩白粒率的QTL4个,分别位于第4、第6、第8和第12染色体上;在原阳F2群体中共检测到控制垩白粒率的QTL3个,分别位于第1、第8和第12染色体上,其中第8和第12染色体上的QTL在海南和原阳两地较为稳定。4、通过极端性状混池重测序与转录组数据联合分析,第8染色体定位区间为0.6Mb,包含64个基因,其中有43个基因在亲本间差异表达,有1 1个基因表达量与24份材料垩白表型显著相关;第12染色体定位区间为8.7Mb,包含401个基因,其中有229个基因在亲本间差异表达,有31个基因表达量与24份材料垩白表型显著相关。因此,最终是筛选到了第8染色体上的1 1个基因和第12染色体上的31个基因,共42个基因,这42个基因作为粳稻垩白调控的候选基因。