胎盘组织中6mA基因修饰在子痫前期发病中的作用

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目的:分析胎盘组织中DNA N6-甲基腺嘌呤(6mA)基因修饰在子痫前期及正常妊娠胎盘组织中的差异表达及相关分子机制,以探讨6mA在子痫前期发病中的作用。方法:收集子痫前期患者与正常对照产妇的胎盘组织,分别提取胎盘滋养细胞中的基因组DNA。将其DNA片段化至100-500bp,采用Ch IP-seq等实验技术对全基因组DNA进行免疫共沉淀,分离基因组的DNA片段。随后,经PCR扩增和片段筛选,构建文库。对已质控的文库进行高通量测序及数据分析,构建子痫前期胎盘组织全基因组6mA甲基化修饰图谱,分析其生物学信息,初步探索6mA与子痫前期之间的关系。最后通过RT-PCR法验证差异基因的表达水平。结果:(1)读长(Reads)结果显示,子痫前期唯一、去重复后的读长数量(115084349)高于正常对照组(112026034)。富集区域(Peaks)分析结果显示,子痫前期胎盘组织中峰(peak)个数(92064)却低于正常对照组(126487)。(2)子痫前期和正常对照组相同基因数量为41924个,子痫前期组特有基因为45625个,正常对照组为78226个。子痫前期组Gene Ontology(GO)分析结果提示,差异基因主要与与线粒体、微管束、细胞器膜及端粒酶复合物的组成,调节氧化还原酶活性、影响翻译抑制活动及死亡结构域形成,影响细胞凋亡过程和调节氧化应激反应。基因组破译方面的数据库(KEGG)分析结果显示,子痫前期组差异基因主要参与戊糖、葡萄糖醛酸转换、抗原加工提呈过程、鞘脂类代谢调控和Rig-1样受体信号通路等。(3)通过KEGG分析结果,挑选子痫前期差异基因(Rig-I样受体信号通路)进行RT-PCR验证,结果显示子痫前期组相关基因转录表达水平低于正常对照组。结论:子痫前期与正常产妇胎盘组织中6mA基因修饰分布存在差异,差异基因参与细胞的多种生物学作用。相关差异基因的6mA甲基化与子痫前期胎盘滋养细胞Rig-I样受体信号通路表达抑制有关,可能参与子痫前期的发病机制。
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