真核生物中,小RNA介导的基因沉默通过调控基因表达参与宿主的生长发育以及对生物和非生物逆境的响应。大量的研究表明真核生物细胞中的Argonautes (AGOs)、Dicers (DCRs)、Dicer-like (DCLs)与RNA-dependent RNA Polymerases (RdRPs)等是基因沉默过程中的关键组份。在双子叶植物中,RdRP参与RNA沉默或抗病毒途径,但其在水稻中的功能则了解得较少。在本研究中,我们扩增并克隆了水稻RDR1(OsRDR1)基因并测定了其序列。序列分析表明该基因共含有5个外显子和4个内含子。实时定量分析表明OsRDR1基因的表达受水稻条纹病毒(rice stripe virus, RSV)侵染诱导,推测其功能可能与水稻抗病毒特性相关。接着,我们通过实验证实了水稻转座子Tos17插入突变体株系ND2001即为Osrdr1突变体,PCR和RT-PCR结果一致表明该突变体中OsRDR1已被完全敲除了。之前的研究已表明该突变体水稻植株比野生型水稻对RSV更敏感。为了进一步探索OsRDR1基因在水稻抗病毒过程中的功能,本研究又应用高通量测序技术分析和比较RSV感染的野生型和突变体水稻植株中RSV来源的小RNA (vsRNAs)。结果表明RSV侵染后,突变体和野生型水稻植株都产生了大量的vsRNAs,而且这些vsRNA均能很好地与RSV正义链或反义链RNA1-4的序列匹配,但是与野生型水稻相比,Osrdr1突变体植株中的vsRNA数量显著减少。这些结果表明OsRDR1基因是水稻抗病毒防卫反应是必须的,并为进一步深入研究OsRDR1参与病毒小RNA (vsRNA)的生物发生过程提供了线索。