本研究通过采用一些先进的技术和方法，探索SARS-CoY的致病机理，对于防止SARS再次侵袭起着积极的推动作用，还可为SARS治疗寻找新的思路和方法。 首先，选择pET22b和pET30a作为SARS-CoY核蛋白表达的质粒，表达可溶性的SARS-CoY核蛋白，利用Ni<2+>鏊和亲和层析和离子交换层析对表达的核蛋白进行了纯化，获得了较纯的可溶性核蛋白。并且将SPR／BIACORE技术与MALDI-TOF MS技术联合起来，利用SPR技术的高灵敏度、高效率、高通量、不需标记物和染料、实时监测生物分子间的相互作用等优点，使用SPR生物传感芯片作为亲和吸附的表面，捕获宿主细胞（2BS细胞、A549细胞和正常人肺组织）裂解物中与SARS-CoV核蛋白相互作用的细胞蛋白，收集足够量的相互作用蛋白，电泳分离后再利用MALDI-TOF MS分析获得蛋白的性质，根据获得的多肽分子量谱，在已有的蛋白数据库中查找相应的蛋白质进行鉴定。经过数据库检索分析，最终确定三种与SARS-CoV核蛋白相互作用的蛋白，目前国内外尚未见类似报道。这三种蛋白分别是：（1）26S蛋白酶调节亚单位S10B（蛋白酶体亚单位p42）（蛋白酶体26S亚单位ATPase 6）（P62333），属于泛素／蛋白酶体系统；（2）细胞角蛋白16（K16）（CK 16）（P08779）；（3）细胞角蛋白14（K14）（CK 14）（P02533）。 根据这些蛋白的开放读码框基因设计引物利用RT-PCR方法从2BS细胞和A549细胞中扩增相应的基因，再将扩增出的26S蛋白酶调节亚单位S10B（p42）开放读码框基因克隆到pGEX-5X-1载体，融合表达p42-GST，用GST融合蛋白pu11down技术再次证实了二者在细胞外的相互作用。使用共聚焦显微镜初步观察到了SARS-CoVNP与p42在2BS细胞内的共定位信号，提示两种蛋白在细胞内相互作用的可能。 26S蛋白酶体管理亚单位S10B属于泛素／蛋白酶体系统中19S调节颗粒的一个亚单位，具有ATPase活性，p42和其它亚单位组装成PA700，调节蛋白酶体的活性，参与泛素化蛋白的降解。泛素／蛋白酶体系统是真核细胞内蛋白质选择性降解的主要途径，而蛋白酶体是UPP中蛋白质降解的场所。蛋白酶体是一种庞大的、多价复合酶，它在承担细胞内蛋白质降解的泛素／蛋白酶体通路的关键步骤中起催化作用。26SATP-依赖的蛋白酶体就是一个巨大的多亚单位的蛋白酶复合体，20S蛋白酶体是26S蛋白酶体的催化核心，也是泛素化蛋白降解的中心；19S调节颗粒参与最初的底物识别和结合而使底物蛋白变性，并将底物折叠并协助底物迁移至20S蛋白酶体水解中心。蛋白酶体不仅可降解自身的蛋白质，而且可降解外源的蛋白质（如病毒蛋白），在病毒感染、细胞免疫及其炎症反应中也发挥重要作用。SARS-CoV核蛋白与p42相互作用在SARS-CoV感染及SARS的发生发展中发挥的作用还有待于进一步深入研究，但这种相互作用的可能机制应与泛素/蛋白酶体系统在生物体内的功能密切相关。根据推测：p42与SARS—CoV核蛋白的相互作用的结果可能会影响病毒抗原的递呈，使病毒逃避了CTL淋巴细胞的杀灭作用；参与了炎症反应，造成了机体器官组织的免疫损伤等。这些研究为进一步揭示SARS-CoV感染机制以及探索SARS的发生机理和治疗手段提供了重要的理论依据。