近年来生态环境问题日益突出,严峻的生态形势引起了社会的高度关注。在本次的国务院机构改革中组建了新的自然资源部,并且将环境保护部上升到了生态环境部,发展目标的转变体现了我国政府对生态环境保护和治理的决心,但是单纯的依靠政府的资金已经难以满足生态环境的巨大资金缺口。因此,对生态补偿项目融资问题研究,探索出适合生态补偿项目的投融资模式,为生态补偿项目提供资金支持具有重要的现实意义,对实现国家生态变革,促进生态系统平衡稳定具有重要的作用。本文首先通过查阅文献资料,对生态补偿和PPP模式的概念进行了阐述,结合当前各方面的需要和实际存在的问题,结合博弈论总结出生态补偿项目应用PPP模式的必要性和可行性。针对生态补偿项目运用PPP模式存在的几个问题,结合生态补偿项目的特征和利益相关者分析,设计出适合生态补偿项目和PPP模式的合作机制,并且通过案例分析来验证这个合作机制在实际项目中具有的可行性。其次,本文从合作机制的退出、绩效评价和风险三个方面进行了分析研究。通过绩效考核和绩效评价给合作机制中的政府和社会资本提供相应的保障。通过构建云模型的风险预警模型,综合分析某项目所形成的合作机制的风险水平来判断项目的风险性,最后结合创新多样的退出机制制度来给本文设计的合作机制提供相应的保障。最后,本文提出了在我国生态补偿项目中运用PPP模式的相关建议,包括建立良好的政策环境和完善相应的法律制度,为推行PPP模式提供条件和依据;构建有利的外部环境,包括透明的信息制度、培养专业的PPP咨询服务机构和PPP项目管理机构;构建对PPP模式的监管体系,确保PPP模式在生态补偿项目中能够顺利的运行。