新型农村合作医疗制度规定是由政府机构、集体经济、农民个人三方共同筹资，目的是为了形成农民的医疗救助机制，使农民也享受到政府的医疗保障制度。从现在新型农村合作医疗的运行中可以看到各级政府每年都会拨付大量的资金，几乎很少有集体具有强大的能力为农民提供参保资金的扶持，农民个人的经济能力的大小决定了参合的积极性高低。农民个人参合积极性直接影响着新型农村合作医疗的有效运行。新型农村合作医疗制度的运行在一定程度上降低了农民因大病花费巨额资金而导致贫困的情况，推动了城乡医保体系的有机结合，提高了农民的健康意识。本论文将新型农村合作医疗的重要作用进行了详细的论述，对国内外的研究成果进行了文献综述。对新型农村合作医疗运行中各方利益主体的博弈过程进行了深入的分析，分析了博弈过程中政府，医疗机构和农民三方利益相关体的博弈过程，并对博弈模型进行分析，得到博弈均衡的最佳状态，并将政府与医疗机构，政府与农民，医疗机构与农民博弈模型的均衡状态与现实进行对照寻找更好的途径使新农合更好的运行。同时将国外在医疗保障方面的政策与新型农村合作医疗政策进行比较，对马庄镇新型农村合作医疗政策运行中存在的问题进行了剖析。如何解决马庄镇在新型农村合作医疗运行中存在的问题，在理论上和现实上都是具有很大的挑战性的。本论文通过分析马庄镇新型农村合作医疗运行中存在的主要问题，找出马庄镇新型农村合作医疗运行中存在困难的原因，并提出了完善新农合运行的措施和建议。通过借鉴与我国国情、经济发展相似的国家的农村医疗保险的先进经验，得出了对发展马庄镇新型农村合作医疗运行的启示，结合马庄镇的具体情况及存在的主要问题和原因的分析，给出自己关于马庄镇的新型农村合作医疗运行中的建议以期望对马庄镇的新型农村合作医疗的后期发展有所帮助。