秦巴山区是我国中西部一个相对封闭的地区,也是精神发育迟滞(MR)的高发区之一。在该地区开展的精神发育迟滞的流行病学调查、病因学研究和家系调查研究结果表明,该地区的精神发育迟滞具有一定的家族聚集性。这一结果提示,遗传因素可能是该地区精神发育迟滞发病的原因之一。因此,深入研究当地精神发育迟滞的遗传病因,是一件很有实际意义且有一定理论意义的工作。FACL4基因是第一个被发现的参与脂肪酸代谢的非特异性精神发育迟滞(NSMR)相关基因。利用连锁分析,并结合PCR测序技术,在意大利的3个MR家系中首次发现了FACL4基因突变,而且这些突变引起家系成员表现为NSMR。为了探索FACL4基因在秦巴山区人群乃至中国汉族儿童NSMR形成中的可能作用,我们首先在秦巴山区的NSMR人群中对该基因进行研究,判断在当地人群中,FACL4基因的突变或其遗传多态性与当地的MR患病率是否相关。在本研究中,我们在对已储备实验样本和现有实验条件等各种因素进行综合考虑之后,选择采用关联分析方法,通过对目标基因的遗传标记位点在病例对照人群中的分布差异来研究目标基因与当地儿童NSMR之间的关系。我们按严格的病例对照设计,从柞水山区及安康北部山区的人群中选取了一个5-14岁汉族儿童病例对照样本,样本数556人(其中118NSMR、116边缘和322对照)。针对目标基因FACL4,并结合目前人类基因组计划及人类单倍型图谱(HAP-MAP)计划等重大研究结果,为目标基因选择了5个最适宜的SNPs位点,即rs5943427,rs12856122,rs5943418,rs7886473和rs10126612,它们可覆盖整个FACL4基因,可以达到我们用关联分析方法对该基因进行研究的目的。采用传统的分子生物学实验操作技术,完成了对5个SNP位点的基因分型工作,得到病例对照样本,然后利用单位点和单倍型关联分析方法,对这几个位点与秦巴山区儿童MR的关系进行检验。单位点关联分析显示这5个SNP位点在MR组和对照组,边缘组和对照组的基因型频率和基因频率均无显著性差异。配对连锁不平衡分析显示,其中4位点(rs5943427、rs12856122、rs5943418和rs7886473)均具有较高的连锁不平衡,D’均大于0.8,r~2大于0.3,因此进行单倍型分析。然而,无论是在NSMR组和对照组,还是在边缘组和对照组中单个和总体的单倍型分布均无显著性差异。总之,在本研究中,我们没有找到FACL4基因多态性与我国秦巴山区汉族儿童NSMR相关的证据。