食源细胞保护性亲电化合物的分子特征挖掘与活性验证研究

来源 :江南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kevinstudy
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
具有细胞保护作用的食物成分是机体对抗营养失衡、环境应激,增强细胞恢复力的重要物质基础。亲电化合物作为食物中广泛存在的一类活性成分,可通过共价修饰生物功能大分子上的亲核位点,发挥正向生物活性或负向生物毒性作用。目前,食源亲电化合物的判别、筛选、评价缺乏系统研究,细胞保护性亲电化合物的分子特征研究尚不充分。本课题通过自主构建食源亲电化合物数据库,基于机器学习算法建立预测模型来判别亲电化合物的正向/负向效应,采用分子对接、福井函数分析揭示细胞保护性亲电化合物与Keap1蛋白的结合作用,进而基于细胞和动物模型评价验证潜在细胞保护性亲电化合物的作用及分子机制。首先,通过结构搜索建立包含332例的食源亲电化合物数据库,并采用f_classif特征选择方法和基于逻辑回归、决策树、支持向量机和半监督K-最近邻(KNN)4种机器学习方法建立正向/负向效应预测模型。结果表明半监督KNN模型对食源亲电化合物数据库的预测效果最佳,总体准确度、精准率和召回率分别达到91.5%、92.6%、97.6%,学习曲线(ROC)的AUC值达到0.74,具有可靠的统计学表现以及较好的预测能力。对29个关键特征值进行聚类分析,结果发现食源亲电化合物中正向/负向效应主要与分子结构中的基团、电负性以及亲脂性这三方面的分子特征相关。对整体数据集分析发现,负向性亲电化合物结构中倾向于出现脂肪族、醚类结构及杂原子,具有更强的亲电能力,而正向性亲电化合物则具有更高的亲脂性能。其次,结合亲电化合物与靶标蛋白先亲和再共价键合的作用过程,采用Autodock Vina软件将正向性亲电化合物与Nrf2抑制蛋白Keap1的Cys151、Cys434位点分别进行分子对接,进而应用Multiwfn软件计算目标化合物的福井函数,最终筛选出4种具有细胞保护潜力的亲电化合物,4-Hydroxyderricin(4HD)、isoliquiritigenin(ISO)、Butein以及10-isobutyryloxy-8,9-epoxythymol isobutyrate(XHY-1)。其Cys151结合能范围为-4.4~-4.6 kal/mol,Cys434结合能范围为-5.7~-6.9 kal/mol,福井函数分别为1.10、1.12、1.11、1.16。共价对接分析表明,4种化合物能通过α,β-不饱和羰基或三元氧环与Keap1Cys151、Cys434的半胱氨酸巯基形成共价键,同时形成氢键、范德华力等次级键,进而影响蛋白构象,具有激活Nrf2信号通路的潜力。进而,基于H2O2诱导的Hep G2细胞氧化损伤模型,采用实时荧光定量PCR、Western blot、si RNA等手段,验证了查尔酮4HD、ISO和Butein的细胞保护作用。结果发现,在10或15μM浓度下,4HD、ISO和Butein均可促进模型细胞Nrf2及下游相关基因(Nqo1、Ho-1、Gsr、Gclc、Gclm)的转录,并促进Nrf2转移到细胞核内,引起Nrf2下游II相代谢酶(Nqo1、Ho-1)的表达上升,细胞内源性抗氧化酶SOD、CAT和GSH-px活性增强,降低ROS水平,减少MDA的生成,缓减H2O2对细胞氧化还原稳态的影响,发挥细胞保护作用。而Nrf2沉默后,ISO上调Nrf2及下游II相代谢酶的转录与翻译水平能力减弱,抗氧化能力下降,ROS水平上升,对Hep G2细胞的保护作用被消除。最后,基于DSS诱导的结肠炎小鼠模型验证了ISO对机体的保护作用。通过组织切片、炎症水平、氧化应激水平分析发现,ISO能够升高小鼠结肠组织中抗氧化酶SOD和CAT的活性,提高总抗氧化能力,有效降低MPO、MDA以及促炎细胞因子(TNF-α、IL-1β、IL-6)的水平,从而减缓溃疡性结肠炎小鼠的体重降低以及结肠长度的缩短,并且缓解便血症状。结合结肠组织中Nrf2信号通路相关基因的分析,推测ISO对结肠炎小鼠的保护作用与Keap1-Nrf2-ARE通路的调控相关。综上所述,本研究建立并优化了基于半监督KNN法的食源亲电化合物正向/负向效应预测模型,通过亲和、共价对接筛选出4例具有细胞保护潜力的亲电化合物,并基于细胞模型验证了4例亲电化合物可激活Nrf2信号通路,且ISO在动物损伤模型中可发挥细胞保护作用的功效。
其他文献
芫根(Brassica rapa L.)属十字花科芸薹属草本植物,主要分布在我国西藏、青海和新疆等地,具有抗缺氧和抗疲劳等多种生物学功能。芫根含有多种活性成分,多糖是其中最主要的活性成分之一。高脂血症是临床上一种常见的代谢紊乱疾病,对其进行早期治疗可以有效预防肥胖、高血压、糖尿病和动脉粥样硬化等疾病的发生。现有的研究表明,多糖对机体的肠道菌群有积极的调节作用,并能够起到调节血脂的作用,但关于芫根多
学位
抑郁症是高度异质性心理障碍,主要临床特征是显著性心境低落和快感缺失。抑郁症患者对抗抑郁药物反应存在不一致性,疾病缺乏统一生物标志物,发病机制以及病理生理机制尚不明确。现有大量研究证明通过调节肠道菌群可以改善抑郁情绪,这为防治抑郁症提供了新思路。低聚木糖(XOS)作为益生元可调节肠道菌群,因此本研究试图探究XOS对抑郁症的预防、改善效果及其生理机制,主要研究内容及结果如下:首先,研究不同剂量XOS对
学位
《春》是统编初中语文教材第一单元的第一篇课文,教师如何施教,直接关系到初中生对初中语文学习的第一印象。教师在教学时,可以采取三条教学路径:“赏春日美景”,让学生通读课文后画出文章的结构图,了解文中都写了哪些春日的景色,再让学生选择自己喜欢的一幅景色进行朗读,体会作者的情感;“品作者童心”,让学生摘录文中符合儿童口吻的语言和契合儿童心理的手法,体会作者借助孩子的视角来写春天的手法;最后通过举办契合课
期刊
蛋清蛋白因其优良的发泡性能可以改善食品体系的蓬松度,因此常被作为发泡剂应用于烘焙产品中。目前针对蛋清蛋白的改性方式多样,但是均存在明显的工业应用局限性,与糖类物质复合提高泡沫性能是一种效果显著、重复性高、易于工业化的方法,然而目前关于不同分子量糖对蛋清蛋白体系泡沫特性的改善机制仍不明确。本文以蛋清蛋白为原料,考察了添加不同分子量糖对蛋清蛋白理化性质、泡沫性能及应用特性的影响,基于气-水界面特性解析
学位
香菇是一种药食两用的食物,因营养丰富而广受消费者喜爱。我国是世界上香菇生产第一大国,香菇粉是我国出口农产品的重要组成部分。香菇加工制成香菇粉以后,失去了特征外形,容易被不法分子掺杂使假骗取国家出口退税。目前国内外针对香菇粉鉴别的方法和技术标准较少,且不能识别香菇柄的掺假,本论文相继发展了显微镜检、近红外快检和香菇多糖HPLC指纹图谱方法,为香菇粉掺假检测提供新方法,为海关等监管机构提供了有效的技术
学位
羟基红花黄色素A(HSYA)是红花的主要活性物质,具有多种生理功能,但其对运动耐力的影响及潜在分子机制尚不明晰。运动耐力是反映身体健康状况的重要指标之一,提高运动耐力不仅有助于改善代谢健康状况,还可以降低患心血管等疾病的风险。基于此,本文通过大孔吸附树脂-制备级高效液相色谱(PHPLC)联用技术从红花水提液中分离纯化出HSYA,深入探究了HSYA干预对运动耐力的影响并揭示其潜在作用机制。本文的主要
学位
目的:观察阶段性康复护理联合营养支持在脑外伤患者中的应用效果。方法:选取2018年6月至2020年6月该院收治的90例脑外伤患者进行前瞻性研究,按照随机数字表法分为对照组和观察组各45例。两组均给予常规护理,在此基础上对照组给予营养支持,观察组在对照组基础上给予阶段性康复护理。比较两组护理前后神经功能缺损程度[美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)]评分、肢体运动功能[Fugl-Meyer运动功
期刊
发酵鱼制品是一种具有典型地方特色的传统水产食品,因其独特的风味而深受消费者喜爱,但为确保食用安全性,传统发酵鱼制品通常具有高盐或高酸的特点。一方面,高盐摄入可能导致心血管疾病的发生,随着营养健康消费需求的升级,腌制发酵食品逐渐向低盐化发展;另一方面,高酸条件下蛋白发生变性,持水性下降,导致产品在熟制过程中口感改变,且过酸的产品也会影响消费者的接受度。如何在低盐低酸条件下保障发酵鱼制品的安全和风味品
学位
双酚A(Bisphenol A,BPA)和双酚S(Bisphenol S,BPS)是两种典型的双酚类化合物,广泛应用于工业生产和日常生活制品中。由于其可赋予产品无色透明、耐挤压性和耐腐蚀性的性质,常用于食品包装材料的制造,大规模生产和使用使其在水体、土壤等不同环境介质中均有检出。同时由于其与雌激素结构相似,经由直接暴露或富集间接接触等途径,往往会对生物体的生殖和发育造成一定程度上的影响,即使是低浓
学位
随着工业的快速发展,环境污染问题日益突出,特别是水资源污染日趋成为人们关注的焦点。其中,工业废水中的酚类有机物及养殖废水中的抗生素如不经深度处理进行排放,会通过一系列渠道在农副产品、畜禽产品、水产品、甚至饮用水中蓄积,造成严重的食品安全问题。而光催化技术和芬顿技术作为两种最常见的处理工业废水的先进氧化技术,具有氧化能力强,反应速度快等的特点,在有机污水深度降解方面具有巨大的应用前景。光催化-自芬顿
学位