为推进政府职能改革，切实履行部门职责，服务海洋强国和交通强国战略发展需求，在充分利用当前海事系统已有的信息资源、管理资源以及服务资源等的前提下，海事系统在多方面进行体制机制改革，全面推进海事资源的整合工作。在此大环境下，针对传统跨区域港口建设费征管模式中存在的不足，研究出新的跨区域港建费协同征管模式，对于防止港口建设费偷缴漏缴，确保其应收尽收，同时提升不同区域间的其他海事业务的协同监管能力，以及完善海事安全监管体系等都有重要的理论意义和实践价值，论文主要研究工作分为四个部分：
　　首先，明确“跨区域”的界定以及“协同”的基础，梳理出跨区域港口建设费征管中各层级的责任划分以及跨区域协同征管的基本要求等。然后简单地就论文研究中需要应用到的复杂网络理论的基础内容进行了介绍，内容包含复杂网络理论的概念、特点以及一些经典模型和有向加权网络等。
　　其次，情况为衡量标准以提出了网络节点重要度评价方法，然后根据提出的有向加权动态融合网络模型，结合传统的跨区域港口建设费征管模式构建出了当前跨区域港口建设费征管网络，并对当前跨区域港口建设费征管网络的融合情况进行了简要分析。
　　再者，提出新的跨区域港口建设费协同征管模式并对其网络特性进行了分析研究。以搭建区域间水平联系平台为目标的提出新的跨区域港建费协同征管模式，根据第三章节提出的网络构建方法同样构建出一个新的跨区域港口建设费协同征管网络。然后利用复杂网络相关分析方法，分析研究两种跨区域港建费征管网络融合程度的不同对网络特性、网络效率、网络鲁棒性等的影响以及新跨区域港建费协同征管网络关键节点所发生的变化情况，结果表明新提出的模式对应的协同征管网在网络整体特性和协同效率方面等具有一定优势且具有更高的可靠性，关键节点的所处层级也更理想。
　　最后，将新提出的跨区域港建费协同征管模式加以展开阐述，详细阐述构建新模式的考虑因素，模式具体的实施从非接触式和接触式协同征管两方面来展开阐述，同时也提出跨区域协同征管相应问题的处理方法以及保障新模式正常运行的保障机制。