细胞分裂素氧化酶(CKX,cytokinin oxidase)通过降解细胞分裂素(CK)参与植物生长发育的诸多过程,是调控植物生长发育的关键因素之一。细胞分裂素氧化酶由细胞分裂素氧化酶基因(CKX)编码,后者往往以多基因家族的形式存在于植物基因组中。玉米中有13个CKX基因,其对玉米植株形态建成有着重要的影响。然而,CKX基因的遗传演化及其遗传变异对玉米农艺性状的影响却少有报道。本研究以32份大刍草、68份玉米地方品种、348份玉米自交系为试验群体,采用华大基因科技有限公司的NimbleGen平台的目标序列捕获技术对CKX基因进行重测序,分析CKX基因在三个群体中的序列多态性,并探究其玉米驯化过程中的演变模式。在此基础上,结合3个环境下测定的12个玉米农艺性状表型数据,采用候选基因关联分析方法,挖掘影响玉米农艺性状的关键变异位点。主要结果如下:1.在448份材料中成功地捕获到玉米CKX基因家族的10个成员,经多序列比对后,对其进行序列变异分析。结果发现,CKX基因在起始密码子上游、内含子、终止密码子下游的核苷酸多态性较高,而编码区(CDS)则相对较低。从驯化过程来看,CKX基因各区段的核苷酸多态性由大刍草、地方品种、自交系依次降低,表明选择压力是作用在CKX基因序列全长范围内的。LD模式分析表明,CKX2、CKX3、CKX9这三个基因受到的选择痕迹比较明显。2.对348份玉米自交系12个玉米农艺性状的统计分析表明,各性状在供试材料间均存在广泛变异。雄穗分枝数的变异系数最大,为43.81%;节根夹角最小,为5.82%。大部分性状之间存在一定的相关性,株高和穗位高的相关性最大,相关系数达到0.57;叶夹角、节根夹角和大部分性状呈负相关或者相关系数较小。3.候选基因关联分析共检测到6个CKX基因的42个变异位点与8个性状显著关联。CKX4的遗传变异对茎粗、叶宽有显著影响,CKX6的遗传变异对叶宽有显著影响。其中,CKX4_SNP-1423、CKX4_SNP-1434与茎粗、叶宽这两个性状关联显著。CKX6中,有9个变异位点与叶宽相关联,其中有5个位点处于较强的连锁不平衡状态。位于启动子区域的CKX6_InDel-1511对叶宽的贡献率R2达到8.63%,而与之强连锁的CKX6_InDel1072造成了氨基酸的非同义突变,贡献率为7.04%。4.在大刍草、地方品种、自交系三个群体中,对关联分析检测到的显著位点的等位变异频率进行比较,结果发现CKK4的SNP-1423、SNP-1434、SNP-1449可能在玉米驯化过程中受到选择。CKX6上的9个显著位点中有7个检测到人工选择信号,非同义突变位点CKX6_InDel1072受到的选择较强,可能是影响目标表型的一个关键位点。本研究结果将有助于明确CKX基因家族在驯化过程中的序列变异情况和遗传演化规律,鉴定出的优异等位变异可用于分子标记辅助选择进行玉米种质改良。