基于网络药理学探究桃仁—红花药对治疗视网膜静脉阻塞的作用机制

来源 :广西中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kalagou
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目的:运用网络药理学技术探究桃仁-红花作用于视网膜静脉阻塞的有效成分和作用机制。方法:运用TCMSP数据库获取并筛选桃仁-红花化合物及靶点,并通过Uniprot软件得到靶点的基因名称;在Gene Cards数据库、Dis Ge NET数据库和CTD数据库检索视网膜静脉阻塞的疾病靶点;运用Venny 2.1.0软件找出药物靶点与疾病靶点的交集靶点,并制作韦恩图;应用STRING数据库、Cytoscape 3.8.2软件建立PPI、药物-成分-靶点、靶点-通路可视化网络图,并进行拓扑属性分析以及筛选网络核心靶基因;应用R软件对靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,预测桃仁-红花治疗视网膜静脉阻塞的作用机制。最后,运用Auto Dock Tools 1.5.6软件将桃仁-红花中关键化合物与对应核心靶点进行分子对接验证。结果:桃仁-红花中共筛选出36个有效化合物,桃仁19个,红花17个,去重后得到211个药物靶点;通过数据库共筛选出11888个疾病靶点,去重后得到药物与疾病交集靶点77个;PPI网络涉及ALB、IL6、TNF、VEGFA、TP53、AKT1、CXCL8、CASP3、MAPK1、CCL2等14个核心靶点。GO富集分析共得到2492个条目,生物过程(BP)2022个,主要有氧化应激反应、细胞对氧化应激的反应、活性氧代谢过程、细胞对化学应激的反应、脂多糖应答等;细胞组成(CC)36个,主要有膜筏(membrane raft)、膜微区(membrane microdomain)、膜区(membrane region)、小窝(caveola)、质膜筏(plasma membrane raft)等;分子功能(MF)97个,主要有细胞因子受体结合、细胞因子活性、受体配体活性、信号受体激活剂活性、蛋白酶结合等。KEGG富集分析共得到147条信号通路,主要涉及AGE-RAGE、IL-17、TNF、HIF-1、动脉硬化、细胞凋亡等信号通路。分子对接结果提示,檞皮素、木犀草素等关键化合物与IL6、TNF、VEGFA、ALB等核心靶点具有较好的结合活性。结论:预测桃仁-红花中檞皮素、黄芩素、山柰酚、木犀草素、β-谷甾醇等核心化合物,主要作用于VEGFA、IL6、TNF、CXCL8、MAPK1、CCL2等关键靶点,参与氧化应激反应、脂多糖应答、免疫应答等生物过程,通过调控AGE-RAGE、TNF、IL-17、HIF-1、动脉硬化、细胞凋亡等信号通路发挥抗血栓、抗炎、抗氧化等重要作用。
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