本研究采用植物DNA提取试剂盒从天麻块茎中提取基因组DNA，并测定其含量；应用随机扩增多态DNA方法研究了天麻基因组DNA多态性；建立了RAPD扩增条件快速优化方法。结果表明：天麻基因组DNA具有多态性；该RAPD扩增条件优化方法是一种简便、快捷、经济、实用的方法，运用该方法进行RAPD扩增，可获得清晰稳定的DNA指纹图谱。 　　本文应用数学公式计算了样本间的RAPD标记共享度和遗传距离系数，探索了遗传距离系数与天麻茎杆颜色和来源地的关系。结果表明：绿杆天麻L2与L3的遗传距离系数最小，遗传关系最近；红杆天麻H4与绿杆天麻L3的遗传距离系数最大，遗传关系最远；遗传距离系数与天麻茎杆颜色和来源地存在明显的相关性。 　　本实验研究分析了天麻遗传类群和DNA分子标记与天麻素含量的关系。结果表明：天麻遗传类群与天麻素含量存在明显的相关性。由H1、H2、H3和L1组成的类群所含天麻素平均量最高，与其它类群的差异极显著。DNA分子标记与天麻素含量也存在一定的相关性，其中DNA序列2是天麻素含量高的天麻遗传类型所特有的分子标记。DNA序列1是所研究的全部天麻样本共有的特异DNA分子标记。它们可用于天麻的真伪鉴别、品种鉴定、基因分型和品种选优选育等。