土鳖虫（Eupolyphaga sinensis Walker）是神农本草中最早记载的珍贵中药。以前的研究表明,土鳖虫在收获、加工、储存和运输等过程中容易被黄曲霉毒素（aflatoxins,AFs）污染,黄曲霉毒素是含剧毒的真菌毒素,对消费者的健康构成了巨大威胁。建立快速的中药材污染真菌鉴定方法能更早地检测出潜在的产毒真菌,并确保中药材的有效生产和安全性。因此,本论文主要的研究内容如下:1.测定56批土鳖虫样品中黄曲霉毒素含量通过高效液相色谱法（High Performance Liquid Chromatography,HPLC）检测了56批来自五省不同药材市场的土鳖虫样品中黄曲霉毒素B₁（AFB₁）、黄曲霉毒素B₂（AFB₂）、黄曲霉毒素G₁（AFG₁）和黄曲霉毒素G₂（AFG₂）含量,结果显示:56批土鳖虫药材中38批次检出含有AFB1,24批次检出含有AFB2,31批次检出含有AFG₁,20批次检出含有AFG₂,25%（14批）样品中AFB1含量超标,30.4%（17批）样品中AFs含量超标。2.中药材土鳖虫污染真菌快速鉴定通过传统真菌培养方法与高通量测序（high-throughput sequencing,HTS）技术对土鳖虫真菌鉴定进行了对比。两种方法都使用内部转录间隔子1（internal transcribed spacer 1,ITS1）和钙调蛋白（calmodulin,CaM）测序进行真菌分子鉴定。本研究中设计的新型CaM引物适用于Mi Seq PE300测序,可用于鉴定DNA样品中的曲霉菌种。与传统真菌培养法相比,基于HTS的土鳖虫样品中发现的真菌种类更多。HTS可以用于获取有关真菌污染物的大量测序数据,总体而言,将ITS1和CaM的测序能力相结合是一种检测和监测土鳖虫中潜在的产毒曲霉菌的有效方法。3.黄曲霉毒素候选酶基因克隆通过两种可食用真菌的cDNA为模板,克隆得到12个黄曲霉毒素候选酶基因,与NCBI数据库比对后序列相似性达99%。