【摘 要】
:
胃癌是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一,胃癌诊断主要依赖内镜检查、组织活检和血液肿瘤标志物检测等。胃镜活检是一项有创检查,目前临床上使用的胃癌标志物的灵敏度和特异度也不高,因此寻找胃癌新型标志物将有可能提高胃癌的诊断水平。由于环状RNA(circular RNA,circRNA)具有结构稳定和广泛存在于各种体液中的特点,探索与胃癌相关的circRNA作为标志物,为胃癌的诊断、预后和有效治疗创造新可能
论文部分内容阅读
胃癌是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一,胃癌诊断主要依赖内镜检查、组织活检和血液肿瘤标志物检测等。胃镜活检是一项有创检查,目前临床上使用的胃癌标志物的灵敏度和特异度也不高,因此寻找胃癌新型标志物将有可能提高胃癌的诊断水平。由于环状RNA(circular RNA,circRNA)具有结构稳定和广泛存在于各种体液中的特点,探索与胃癌相关的circRNA作为标志物,为胃癌的诊断、预后和有效治疗创造新可能。本实验以hsa_circ_0061276为研究对象,使用逆转录-微滴式数字PCR(reverse transcription-droplet digital polymerase chain reaction,RT-ddPCR)Eva Green染料法,对血浆标本中hsa_circ_0061276的拷贝数进行定量检测,分析其作为胃癌标志物的诊断价值;并通过细胞实验探究hsa_circ_0061276在胃癌发生中的可能作用。研究方法1.设计hsa_circ_0061276特异性引物,经测序验证。放线菌素D处理、重复性实验和标本贮存条件实验,验证血液hsa_circ_0061276的稳定性。2.利用RT-ddPCR Eva Green染料法检测健康人,以及胃炎、胃溃疡、胃癌前病变、早期胃癌和进展期胃癌患者血浆中hsa_circ_0061276的拷贝数,分析其在胃癌诊断中的价值。3.首先检测hsa_circ_0061276在胃癌细胞中表达情况,然后构建hsa_circ_0061276上调和下调质粒,转染效果验证;最后分析hsa_circ_0061276对胃癌细胞增殖、迁移和细胞周期等的影响。4.核质分离实验分析hsa_circ_0061276在细胞内定位情况。使用circMir软件预测hsa_circ_0061276的微小RNA(micro RNA,miRNA)海绵作用。实验结果1.琼脂糖凝胶电泳结果及TA克隆测序均证实扩增产物与预期相符。放线菌素D实验说明hsa_circ_0061276的半衰期比其亲本基因核受体相互作用蛋白1(nuclear rector interacting protein 1,NRIP1)mRNA的半衰期更长;重复性实验和标本贮存条件实验说明血浆hsa_circ_0061276稳定性好。2.利用RT-ddPCR成功在人血浆中检测到hsa_circ_0061276的拷贝数。随着病程进展,血浆hsa_circ_0061276拷贝数有下降趋势。组别相互比较,发现健康组与进展期胃癌组比较的结果最佳,受试者工作特征曲线下面积为0.7380。3.转染实验结果显示,hsa_circ_0061276过表达和干扰质粒均有效。过表达hsa_circ_0061276后,细胞计数试剂-8和集落形成结果显示,胃癌细胞的增殖能力均被抑制,迁移能力也有下降。当下调hsa_circ_0061276表达时,胃癌细胞的增殖、迁移能力均有不同程度的加强。流式细胞仪检测过表达和下调hsa_circ_0061276后胃癌细胞的细胞周期,结果发现过表达后胃癌细胞被阻滞在G1期,下调后胃癌细胞却在S期增加。4.在明确hsa_circ_0061276定位于细胞质中和预测出hsa_circ_0061276具有miRNA海绵功能的基础上,筛选出3个在胃癌中高表达的miRNA(hsa-miR-6504-5p、hsa-miR-7705和hsa-miR-7974);经转染它们的类似物,下调了胃癌细胞中hsa_circ_0061276的表达。双荧光素酶报告基因实验和CCK-8增殖实验说明hsa_circ_0061276具有miRNA海绵功能,且hsa-miR-7705可能参与抑制hsa_circ_0061276的表达。研究结论1.hsa_circ_0061276有希望成为胃癌新型标志物,对于胃癌诊断具有一定的价值。2.细胞水平实验说明hsa_circ_0061276可能通过充当miRNA海绵发挥抑癌作用。
其他文献
病毒是自然界种类最丰富和多样化的生命体形式,能寄生包括动物、植物、细菌、真菌,甚至病毒在内的所有生命体,目前普遍认为自然界的未知病毒数量要远远超出已知病毒数量。随着高通量测序技术的发展,近10多年新发现的病毒数量急剧上升,国际病毒学分类委员会(International Committee for Taxonomy of virus,ICTV)记录的病毒种类从2008年的2079种增加到2018年
辣椒脉黄病毒(Pepper vein yellows virus,Pe VYV)属于马铃薯卷叶病毒属(Polerovirus),传播方式仅限于蚜虫传播和通过嫁接传播,病毒发生侵染后,辣椒叶片会出现卷曲,叶脉会产生黄化等症状,影响辣椒品质及产量。本研究针对云南、安徽、浙江等辣椒产区的共263份样品进行了检测,通过转录组高通量分析以及RT-PCR确认,明确云南地区Polerovirus病毒中Pe VY
由小麦黄花叶病毒(Wheat yellow mosaic virus,WYMV)引起的小麦黄花叶病严重影响了小麦生产安全。尽管目前利用生物学和分子生物学已对WYMV有了初步研究,但由于缺乏有效的WYMV侵染性克隆,仍无法利用反向遗传学对WYMV与寄主的互作机理进行研究。本研究成功构建了WYMV的侵染性克隆,并明确了WYMV侵染的最适温度。同时利用该侵染性克隆,对Ta WRKY22在小麦抗WYMV中
我国是世界上淡水珍珠生产和出口大国,但传统养殖模式下产出的珍珠品质参差不齐,还导致严重的水体污染。随着相关限养禁养令的出台,珍珠养殖产量大、品质低的产业特征亟待改善,必须建立起与生态环境更友好的养殖模式。在水产养殖过程中,养殖水质和细菌对水生生物的生长发育和疾病防治有至关重要的作用。本研究主要探究饵料微藻,外源钙离子、培育方式和益生菌对三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)养殖水质(pH
目的:利用组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂进行表观遗传治疗已成为新药开发中一个重要领域。DNA甲基化和组蛋白乙酰化是调控白血病发生发展的重要表观遗传学途径。在之前的研究课题中我们基于苯甲酰胺片段选择性抑制Ⅰ型组蛋白去乙酰化酶的特征,设计了N-(2-氨基苯基)苯甲酰胺吖啶类似物8a-8p。分子对接、体外酶活性筛选和进一步的机理研究验证了目标化合物具有选择性抑制HDAC1酶活性作用,并显著抑制白血病
小麦黄花叶病毒(Wheat yellow mosaic virus,WYMV)是一种植物RNA病毒,主要由土壤中的禾谷多黏菌进行传播,每年都会给我国的小麦生产带来严重损失。为了解析WYMV致病及逃避植物寄主防御的分子机制,本研究以WYMV P1蛋白为诱饵来捕获与之相互作用的寄主因子。通过实验,最终一共得到了9个可能与P1互作的寄主因子,其中候选寄主因子“ubiquitin-specific pro
目的白细胞介素(interleukin,IL)-41又名Metrnl,它是一种与神经营养蛋白Metrn同源的新型细胞因子,能够调节脂质代谢和炎症反应。但IL-41对肝损伤的影响还未见报道。刀豆蛋白A(concanavalin A,Con A)诱导的肝损伤模型被运用于各种肝炎疾病的研究。本研究通过Con A诱导小鼠急性肝损伤,研究IL-41在小鼠肝损伤中的作用及机制,为临床自身免疫性肝脏疾病的治疗提
鱼类常见病原菌迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)为革兰氏阴性菌,且能入侵并在宿主吞噬细胞内复制,具有宿主范围广的特点。然而目前迟缓爱德华氏菌进入鱼类单核/巨噬细胞(monocytes/macrophages,MO/MΦ)的机制尚不清楚,对于这一机制的理解,有助于寻找合适的抗病策略。迟缓爱德华氏菌感染的大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostri,mudsk
背景:视网膜病变是糖尿病患者严重的并发症之一。糖尿病视网膜病变(Diabetic retinopathy,DR)也是劳动年龄人群视力损伤的主要原因,多数患者在进入晚期前并无明显症状,早发现有益于减缓症状和发病进程,早期筛查糖尿病患者是否有眼部病变尤为重要。外泌体是盘状的双层膜囊泡,主要起到信息传递和胞间调节作用,其内含物m RNA可作为有潜力的非侵入性糖尿病视网膜病变早期筛查标志物。目的:本次研究
目的炎症性肠病是慢性肠道疾病的一种,目前仅指溃疡性结肠炎(Ulcerative colitis,UC)和克罗恩病(Crohn’s disease,CD)。右旋糖酐硫酸钠盐(Dextran sodium sulfate,DSS)是诱导实验性小鼠UC的常用药物,在饮用水中给药会导致小鼠急性结肠炎。白细胞介素-36受体拮抗剂(Interleukin 36 receptor antagonist,IL-3