论文部分内容阅读
为了探讨中国晋冀蒙地区汉族人群中ESR1基因多态性与甲状腺乳头状癌（Papillary thyroid carcinoma,PTC）发病风险是否相关。采用病例-对照研究方法,收集2017年1月～2018年10月间,经河北北方学院附属第一医院耳鼻咽喉—头颈外科手术后确诊的123例PTC患者为病例组,同期来自河北北方学院附属第一医院体检中心的108例健康参与者为对照组。所有研究对象均为中国晋冀蒙地区的汉族人群。以抗凝管采集每位实验参与者晨起空腹外周静脉血约5 ml,采用血液基因组DNA提取试剂盒提取样本血液基因组DNA,SNa Pshot技术对ESR1基因rs1884051 G/A、rs2077647 T/C、rs3798577 T/C、rs1801132 G/C、rs2234693 T/C、rs9340799 A/G、rs3020314 C/T、rs1514348 A/C的8个单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism,SNP）位点进行基因分型。拟合优度χ2检验分析ESR1基因8个SNP位点基因频率分布是否符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律。?2检验评价ESR1基因SNPs位点在组间的基因型和等位基因频率的分布差异。非条件Logistic回归模型校正混杂因素后,分别计算各SNP位点内部基因型、等位基因的比值比（Odds Ratio,OR）和95%置信区间（Confidence Interval,CI）。SHEsis在线软件分析SNPs位点间连锁不平衡（Linkage Disequilibrium,LD）,并分析较强连锁的SNPs位点组成的单倍型与PTC的发生风险。结果显示:对照组ESR1基因2个SNP位点rs9340799、rs3798577的基因型频率分布不满足Hardy-Weinberg遗传平衡定律,表明本次选取的这2个SNP位点的对照组群体不具有代表性,因此未对这2个SNP位点进一步分析;其余6个SNP位点rs1884051、rs2077647、rs1801132、rs2234693、rs3020314、rs1514348在PTC组与对照组均满足遗传平衡定律。PTC组与对照组ESR1基因rs1884051、rs2077647、rs1801132、rs2234693、rs3020314、rs1514348位点基因型和等位基因频率的分布差异显示:rs1801132位点基因型以及等位基因频率分布在PTC组与对照组差异均有统计学意义（均为P<0.05）;rs1884051、rs2077647、rs2234693、rs3020314、rs1514348位点基因型以及等位基因频率分布均无统计学意义（均为P>0.05）;非条件Logistic回归分析结果显示,rs1801132位点基因型GC、CC可增加PTC的发病风险,突变等位基因C是健康人群发生PTC的危险因素(ORGC/GG=4.289,95%CI:2.210-8.321,P=0.000;ORCC/GG=15.425,95%CI:3.319-71.692,P=0.000;ORC/G=4.728,95%CI:2.789-8.014,P=0.000)。按性别分层时,男性群体rs2077647、rs1801132位点基因型和等位基因频率在PTC组与对照组分布均有统计学意义（均为P<0.05）,rs1884051、rs2234693、rs3020314、rs1514348位点的基因型和等位基因频率分布均无统计学意义（均为P>0.05）;非条件Logistic回归分析结果显示,rs2077647位点基因型TC、CC可降低PTC的发病风险,突变等位基因C是健康男性发生PTC的保护因素(ORTC/TT=0.175,95%CI:0.031-0.979,P=0.047;ORCC/TT=0.067,95%CI:0.009-0.494,P=0.008;ORC/T=0.303,95%CI:0.131-0.701,P=0.005);rs1801132位点基因型GC、CC可增加PTC的发病风险,突变等位基因C是健康男性发生PTC的危险因素(ORGC/GG=12.917,95%CI:2.816-59.252,P=0.001;ORCC/GG=26.995,95%CI:2.552-285.544,P=0.006;ORC/G=8.710,95%CI:3.059-24.795,P=0.000)。女性群体rs1801132位点基因型和等位基因频率分布在PTC组与对照组均有统计学意义（均为P<0.05）,rs1884051、rs2077647、rs2234693、rs3020314、rs1514348位点的基因型和等位基因频率分布均无统计学意义（均为P>0.05）;非条件Logistic回归分析结果显示,rs1801132位点基因型GC、CC可增加PTC的发病风险,突变等位基因C是健康女性发生PTC的危险因素(ORGC/GG=3.157,95%CI:1.515-6.579,P=0.002;ORCC/GG=13.471,95%CI:1.688-107.474,P=0.014;ORC/G=3.740,95%CI:2.045-6.838,P=0.000)。按年龄分层时,年龄<45岁的群体rs1801132位点的等位基因频率分布,在PTC组和对照组均有统计学意义（P<0.05）,rs1884051、rs2077647、rs2234693、rs3020314、rs1514348位点的基因型和等位基因频率分布均无统计学意义（均为P>0.05）;非条件Logistic回归分析结果显示,rs1801132位点突变等位基因C是年龄<45岁的健康群体发生PTC的危险因素(ORC/G=3.771,95%CI:1.158-12.283,P=0.028)。年龄≥45岁的群体中,rs1801132位点的基因型和等位基因频率分布在PTC组和对照组均有统计学意义（均为P<0.05）,rs1884051、rs2077647、rs2234693、rs3020314、rs1514348位点的基因型和等位基因频率分布均无统计学意义（均为P>0.05）;非条件Logistic回归分析结果显示,rs1801132位点基因型GC、CC可增加PTC的发病风险,突变等位基因C是年龄≥45岁的健康群体发生PTC的危险因素(ORGC/GG=4.006,95%CI:1.939-8.275,P=0.000;ORCC/GG=32.576,95%CI:3.878-273.619,P=0.001;ORC/G=5.079,95%CI:2.802-9.207,P=0.000)。为了探求SNPs多点联合与PTC的发病风险,对rs1884051、rs2077647、rs1801132、rs2234693、rs3020314、rs1514348进行LD检验,结果显示rs2077647、rs2234693、rs1514348位点,两两之间分别存在较强的连锁,rs2077647-rs2234693（D’=0.804,r2=0.646）,rs2077647-rs1514348（D’=0.759,r2=0.444）,rs2234693-rs1514348（D’=0.810,r2=0.506）;与其他单倍型相比rs2077647-rs2234693-rs1514348的单倍型T-C-C可增加PTC发病风险（P=0.04,OR=3.025,95%CI:1.003～9.123）,余单倍型频率分布在PTC组与对照组均无统计学意义（均为P>0.05）。综上所述,我们认为中国晋冀蒙地区的汉族人群中ESR1基因rs1801132、rs2077647位点的单核苷酸多态性可能与PTC发病风险有关;rs2234693、rs3020314、rs1884051、rs1514348位点单核苷酸多态性可能与PTC发病风险无关;ESR1基因rs2077647-rs2234693-rs1514348位点组成的单倍型T-C-C与PTC的发病风险有关。