农业综合开发作为国家促进和保护农业发展所制定的重要战略措施，同时也推动了小康社会的全面建设，其运行的前提和保证是良好的投入机制和管理模式。我国作为一个农业大国，农业人口占人口总数一半以上，在国家改革开放和现代化建设中，农业、农村、农民问题一直是国家全局发展的重点。在国家实行双轨体制（家庭承包经营和统分结合）的前提下，如何提高农民参与农业生产的积极性及推动农业与农村经济有效健康发展，是当前国家农业和农村经济所遇到的深层次矛盾和问题。当前，我国的国民经济已经进入全新阶段，对外开放发展、社会主义新农村建设以及社会主义现代化建设的高速发展为国家农业发展都提出了前所未有的机遇与挑战。农业综合开发作为农村经济发展工作的重要组成部分，对农村和农业经济结构调整，农村生产和生活条件的改善以及农民增收等方面都具有重要促进作用。文章首先对当前经济环境下，农业综合开发如何应对我国经济发展所带来的机遇和挑战以及在农村经济中如何发挥自身优势和作用等进行了详细论述；其次通过对农业开发项目管理发展理论及实践进行分析，在项目前期阶段、项目实施阶段和项目竣工阶段对我国农业综合开发项目所存在的问题进行分析。同时，根据国家发展实际，从项目管理理念、管理体制、管理方法和技术等方面分析我国农业综合开发项目管理问题的成因。另外根据我国经济发展的需要，文章借鉴了世界银行农业投资项目管理模式，详细介绍和分析了项目管理模式特点与项目管理周期。通过世界银行农业投资项目准备与选定、项目谈判及评估、项目执行及监督与评价基础上，在项目前期准备、项目经理责任制、项目采购、内外控制、执行等方面提出了对我国农业综合开发项目的启示。针对我国农业综合开发项目问题及成因，同时借鉴世界银行农业投资项目管理模式和经验基础上，从项目管理目标、项目管理模式构建及运行等方面对我国现阶段农业综合开发项目管理模式进行分析。在对上述问题进行分析的基础上，并结合我国农村经济发展的实际，对我国农业综合开发项目管理方面如何通过合理规划进行改善，提出了相应的对策和建议，从而进一步推动国家农业综合开发持续稳定发展，加快农业现代化建设。