长链非编码RNAs表达水平及其基因单核苷酸多态性与类风湿关节炎的关联性研究

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研究背景类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)属于慢性自身免疫性疾病,以自身抗体、系统炎症和持续性滑膜炎为主要特征,多侵犯肢体小关节,最终导致关节退化、变形并丧失功能。目前,RA的全球成年人患病率约为1%,疾病负担沉重,发病机制也尚不清楚。已有研究发现,RA发病可能与环境、遗传、自身免疫调节、感染以及内分泌异常等多种因素有关,其中,遗传因素扮演重要角色。RA遗传背景复杂,涉及编码基因和非编码基因。编码基因在既往研究中得以广泛报道,而非编码基因与RA的关联研究非常有限。非编码RNA中的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)核苷酸长度≥200个核苷酸、数量庞大且种类繁多,能从转录水平、转录后水平、蛋白质代谢和表观遗传水平等多层面参与基因转录、RNA剪接、染色质重塑和蛋白质转运等多种生物学过程。最近,多种lncRNAs被证实在人外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)中稳定存在,对调节人体免疫系统具有重要作用,被认为可能参与由免疫介导的炎症性疾病的致病过程。新近研究提示,lncRNAs在RA发病过程中可能同样发挥着作用。目的比较RA患者与健康对照人群PBMCs中lncRNAs(linc0597,GAS5和H19)的表达水平,探讨lncRNAs的基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与中国汉族人群中RA易感性之间的关联。方法本研究分两个阶段,均采用病例对照设计方案。第一阶段,运用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测77例RA病例和78例健康对照人群的PBMCs中lncRNAs(linc0597,GAS5和H19)表达水平。第二阶段,通过Fluidigm EP1平台以及Taq Man SNP探针分型方法检测626例RA病例和650例健康对照人群lncRNAs的SNP。采用Epi Data 3.1数据库双录入调查问卷资料,采用SPSS 23.0软件分析数据。检验水准α=0.05。结果(1)第一阶段在77例RA病例和78例健康对照人群PBMCs中检测lncRNAs表达水平时,发现GAS5、linc0597和H19在RA病例PBMCs中表达水平均低于健康对照人群,差异有统计学意义(Z=-4.821,P<0.001;Z=-6.095,P<0.001;Z=-2.330,P=0.020)。进一步分析lncRNAs表达水平与RA患者的主要实验室指标、疾病活动度和临床用药等的关联,发现GAS5在低补体RA患者中表达下调(Z=-2.259,P=0.024),并与C反应蛋白(C-reaction protein,CRP)水平相关(r_s=-0.273,P=0.017);linc0597和H19表达水平与RA主要实验室指标、疾病活动度和临床用药均无关联(均有P>0.05)。(2)第二阶段在626例RA病例和650例健康对照人群中检测lncRNAs的SNP时,发现GAS5的rs6790,H19的rs2067051和rs2075745,linc0597的rs2070107、rs2877877、rs2632516和rs2285991等位点在调整性别和年龄前后,无论是基因型频率、等位基因频率,还是显性模型和隐性模型等遗传模型,在两组间的差异均无统计学意义(均有P>0.05)。进一步分析SNP在RA患者中与类风湿因子(rheumatoid factor,RF)和抗环瓜氨酸抗体(anti-citrullinated protein antibodies,ACPA)等主要实验室指标间的关联,也未发现有统计学差异的结果(均有P>0.05)。(3)在59例RA患者中研究lncRNAs的SNP与其在PBMCs中的表达水平之间关联,发现关联结果均无统计学差异(均有P>0.05)。结论GAS5、linc0597和H19在RA病例PBMCs中表达水平均下调。进一步研究发现,GAS5在低补体RA患者中表达下调,并与患者的CRP水平呈负相关,进一步提示GAS5可能在RA的发病过程中发挥重要的角色。GAS5、linc0597和H19的SNP与RA易感性无关联。
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