金鱼(goldfish)属于鲤形目(Cypriniformes)、鲤科(Cyprinidae)、鲫属(Carassius),是我国特有的观赏鱼类,起源于晋代的赤鳞鱼,经过多年的杂交选择育种后获得了各种性状的品种。至今,人们对金鱼的选育仍采用传统的性状杂交选择育种,这种方式能获得较多观赏价值高的品种,但具有随机性,且耗时、耗材和效率低。头瘤类金鱼由于其头部肉瘤的观赏价值而深受喜爱,部分品种头瘤的组分构成及结构已被揭示,但对头瘤形成的分子调控机制等方面尚不清楚。本研究以一龄红狮头的头瘤组织作为检测子(Tester),草金和40日龄红狮头幼鱼的头顶上皮组织作为驱动子(Diver),利用消减抑制杂交技术分别从生长和进化的角度构建了2组关于金鱼头瘤功能基因的差减cDNA文库。以鲫管家基因α-tubilin为参照,构建的cDNA文库差减效率为210倍。采用特异引物PCR和斑点杂交对文库单克隆进行筛选、测序,共获得有效序列243条,去掉接头和载体序列后进行Blast比对,取E值小于10-5者为已知基因,共有163条序列具有功能已知的同源基因、35条序列具有功能未知的同源基因和45条序列无比对结果(可能为新基因)；利用Blast2go软件对所构建的文库序列进行GO功能分类注释,两组文库基因的功能主要聚类均为结合蛋白、催化活性和转运活性。采用Uniprot数据库对GO注释的基因进行功能、结构、作用机制、组织特异性等方面的分析,寻找与头瘤形成相关基因。从文库中筛选出可能与金鱼头瘤形成相关的基因进行了不同组织和不同时相的表达分析,以进一步鉴定头瘤功能基因。取红狮头成鱼的心、肝、脾、肾、鳃、瘤、肌肉、肠、皮等组织,对待选基因进行半定量分析,从中筛选得到5条头瘤特异表达的基因序列：Fat2、K18、MAM2、RhoV、 PTX3。分别提取2月龄红狮头(头瘤即将生长)、4月龄红狮头(头瘤刚生长出来)和一龄红狮头(头瘤发育完全)3个时间段的组织,对这5条特异基因进行不同时相的定量分析,结果表明这些基因在头瘤生长的过程中呈现出不同的表达形式,其中RhoV、K18和PTX3在红狮头2月龄到4月龄长出头瘤这个阶段表达量变化较大,Fat2在红狮头4月龄到1龄头瘤生长成熟的阶段表达量变化较大,而MAM2在这个红狮头生长过程中表达量较稳定。