本文主要在生态文明和生态县建设的背景下,研究县域经济主导产业的选择问题。从工业文明进入生态文明,经济增长与环境保护出现了严重的失衡现象,引起各界对县域主导产业选择标准的重新审视。主导产业作为区域经济发展的领头羊,代表着区域产业经济的方向。正确地选择符合生态文明和生态县建设的主导产业,不仅能充分发挥当地的经济优势,还能够更好的保护环境,实现“生态-经济-社会”的和谐与共赢。本文综合运用可持续发展、生态经济学、主导产业选择、区域经济学等相关理论和现有研究成果,结合理论分析与实证分析,从生态县建设下主导产业的内涵界定入手,提出生态县的主导产业应具有保护生态环境、带动经济发展和促进社会和谐三方面特征,重点发展绿色农业、绿色工业和绿色服务业。基于此,进一步提出了主导产业的选择基准——生态型基准、社会型基准、经济型基准及其具体的指标体系。2013年底,长汀入选国家级生态文明建设试点县,是福建省生态县和第一个国家水土保持县。本文在对长汀生态县建设的战略决策和产业发展现状分析的基础上,提出生态县建设要发展“绿色经济”的产业模式,即绿色农业、绿色工业和绿色服务业,并进一步提出生态县建设的主导产业选择基准,必须把生态型基准放在与经济型基准同等重要的位置,同时还要兼顾社会型基准,并以此建立指标体系。基于工业对推动长汀经济发展的主导地位突显,发展速度快,并且对于生态资源和环境的依赖与破坏程度逐渐加深,经济发展和生态县建设矛盾突出,所以本文以长汀工业主导产业选择作为实证分析。以长汀县工业的22个产业作为研究对象,对12个指标进行了量化分析,通过因子分析法,并结合长汀实际产业结构进行综合评价分析,选出有助于生态县建设的工业主导产业——纺织服装业、农副产品加工业、机械电子业和稀土深加工业,并提出有助于长汀主导产业发展的政策建议。