蜻蜓目(Odonata)隶属昆虫纲的有翅亚纲,是比较古老的中小型有翅昆虫。现存种类包括差翅亚目(Anisoptera)、束翅亚目(Zygoptera)和间翅亚目(Anisozygoptera,仅两属两种)三个亚目。全世界估计有10000种左右,已知蜻蜓有5600种,中国已报道663种。蜻蜓目昆虫既是一类天敌昆虫,又是药用和食用昆虫,同时也是水体污染程度的指示昆虫之一,具有巨大的研究价值。关于蜻蜓的科级分类一直存在许多争议,所以也是蜻蜓目(Odonata)昆虫系统发育研究中的一个热点。虽然前人从形态学、分类学、生态学、行为学、生理学、生物地理学、分子生物学等角度对此作了一些研究,但是总体来说研究不够深入,仍然存在很多分歧。本研究基于线粒体基因COI和核基因28SrDNA的部分片段序列,对蜻蜓目6科15属21种昆虫的系统发育进行了探讨。用直接PCR法扩增两个基因片段,送生物公司进行DNA测序,共获得20条COI基因部分序列(662bp)和17条28SrDNA基因部分序列(571bp)。以内蒙古笨蝗作为外群,采用CLUSTALX1.81、MEGA4.1等系统发育分析相关软件对序列进行了比对、碱基组成、碱基替换、遗传距离等进行了序列组成分析；通过碱基替换饱和性分析、g1及PTP检验等分析方法对序列进行了系统发育信号检测,结果显示所测定的序列具有较强的系统发育信号。利用PAUP4.0及MrBayesV3.1生物学软件采用最大似然法(ML)、贝叶斯推论法(BI)、最大简约法(MP)建树方法重建蜻蜓目6科部分种类的系统发育关系,得出以下结论：1.在不包括外群在内的所有种类线粒体COI基因序列中,碱基A+T,平均含量为63.2%；碱基G+C,平均含量为36.8%,表现出明显的A+T含量偏向性(其中A=29.2%；T=34%；C=18.3%；G=18.5%)。核基因28SrDNA基因非常保守,在不含外群时,全部571个位点有453个保守位点；只有108个变异位点。两种基因序列的组成存在很大的差异,这可能是线粒体和核基因进化速度不同的一个原因。2.比较采用MP、ML以及BI方法构建的线粒体基因COI、核基因28SrDNA以及联合基因数据集COI&28SrDNA系统发育树之间的差异,结果表明本研究所采用的线粒体基因COI部分片段序列可以有效的用来分析蜻蜓目属间的系统发育关系；核基因28SrDNA基因部分片段序列可以用来分析蜻蜒目科间的分子系统进化关系；联合基因序列,可以明确的得出科、属间的系统发育关系。4.由系统发育树综合得出的结果表明的各科、各属间的亲缘关系与现用的分类系统大体一致。与传统的形态学分类不同的是：色蟌属的所有种类没有稳定的聚在一起,华艳色蟌、褐顶色蟌和烟翅绿色蟌比较稳定聚在一个并系群内；而亮翅绿色蟌在联合建树时与差翅亚目的种类聚在同一类聚内,说明它与差翅亚目的进化关系较束翅亚目更近；色蟌属的进化关系不明确需要进一步研究探讨。4.基于线粒体基因COI和核基因28SrDNA的部分片段序列对蜻蜓目部分种类进行系统分子进化研究结果表明：(1)所研究的6科蜻蜓目昆虫的系统进化关系为：(((丝蟌科,蟌科),色蟌科),((蜓科,箭蜓科),蜻科))),蜻科为较进化的类群,丝蟌科为较原始的类群；(2)蜻科5个属间的系统进化关系为：(红蜻属,((黄蜻属,赤蜻属),(蜻属,灰蜻属))),红蜻为较古老的类群,灰蜻为较进化的类群,蜻属与黄蜻属的进化关系较近,灰蜻属与蜻属的进化关系较近。