肠道病毒71型SHZH03株VP1基因的进化分析

来源 :生物技术通讯 | 被引量 : 0次 | 上传用户：niuniu31

【摘要】

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构建了肠道病毒71型(EV71)中国(深圳)分离株SHZH03全基因组的8个相互重叠的克隆,对其全基因组7406 bp的核苷酸进行序列测定,利用DNA-Star软件分析外壳蛋白基因VP1的遗传进化.

【作者】

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周世力李琳琳田波

【机构】

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江汉大学,中国疾病预防控制中心

【出处】

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生物技术通讯

【发表日期】

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2005年6期

【关键词】

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肠道病毒71型 VP1基因基因分型 enterovirus type 71 VP1 gene phylogenic analysis

【基金项目】

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湖北省科技攻关项目

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构建了肠道病毒71型(EV71)中国(深圳)分离株SHZH03全基因组的8个相互重叠的克隆,对其全基因组7406 bp的核苷酸进行序列测定,利用DNA-Star软件分析外壳蛋白基因VP1的遗传进化.结果表明,SHZH03和SHZH98与亚洲流行株中的台湾1998年流行株、日本1999年流行株的遗传距离较近,而与新加坡2000年和2001年流行株的遗传距离较远;SHZH03株与一些欧洲流行株有较大的差异.以上结果说明我国深圳地区流行的肠道病毒71型有可能来源于台湾1998年的EV71大规模流行时的毒株.

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