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代海丽(1986-),女,硕士研究生,讲师,主要从事病理学和病毒学相关研究。
摘要:目的:诱导表达柯萨奇B3病毒(CVB3)的VP1蛋白。
方法:针对CVB3基因的VP1区设计特异性引物,RT-PCR扩增VP1基因并将其克隆到pGEX-6p-1中,经IPTG诱导表达VP1蛋白。采用SDS-PAGE和Western blot检测VP1特异性蛋白的表达情况。
结果:SDS-PAG在相对分子量约54kD处可见目的条带,Western blot检测亦相对分子量约54kD处见到了清晰的蛋白条带。
结论:成功诱导表达了特异性较高的VP1蛋白。
关键词:柯萨奇B3病毒原核表达融合蛋白
【中图分类号】R4【文献标识码】A【文章编号】1671-8801(2013)11-0006-02
柯萨奇病毒B3(CVB3)属小RNA病毒科,肠道病毒属。流行病学调查显示,约50%的病毒性心肌炎与肠道病毒感染有关,特别是与CVB3的关系最为密切。同时,CVB3还会引起肝炎、胰腺炎和无菌性脑膜炎等疾病。近年来其发病呈上升趋势,但目前尚缺乏有效的防治措施。CVB3呈球形,直径约22~30nm,为单正链的RNA病毒,具有mRNA活性和感染性,全长为7397个核苷酸。依据其功能分,可分为5′端非编码区(5′-untranslated region,5′-UTR)、P1区、P2区、P3区、3′端非编码区(3′-UTR)和一个Poly(A)尾。P1区编码病毒的主要结构蛋白即衣壳蛋白,该区由VP1、VP2、VP3和VP4组成,其中VP1蛋白为病毒的主要中和抗原。病毒的主要中和抗原位点位于VP1上,VP4序列高度保守,但不暴露在衣壳的外面,故不具有中和性抗原位点[1]。本研究将VP1基因插入pEGX-6p-1表达载体中,构建了pEGX-VP1重组质粒,并诱导表达了GST-VP1融合蛋白,从而为建立CVB3的免疫生物分析方法奠定基础。
1材料与方法
1.1材料。
1.1.1主要材料:CVB3由哈尔滨医科大学病原微生物实验室钟照华教授馈赠。
1.1.2抗体和试剂:pMD18-T载体、限制性内切酶、ExTaq购自宝生物工程(大连)有限公司;原核表达载体pEGX-6p-1为本实验室保存;山羊抗鼠HRP-IgG均购自中杉金桥生物技术有限公司;感受态E.coli BL21(DE3)购自天根生化科技有限公司;其他常用化学试剂为国产或进口分析纯。
1.2方法。
1.2.1引物的设计与合成:采用Primer Express 2.0软件,根据CVB3的核苷酸序列,在VP1区设计特异性引物VP1-F:5’-ATGCAGACACGCCACGTTAAG-3’,酶切位点为:BamHⅠ;VP1-R:5’-CGTATTTGTCATTGTAGTGAT-3’,酶切位点为:XhoⅠ,用于扩增VP1基因(702bp)。引物由上海英骏生物技术有限公司合成。
1.2.2VP1基因的扩增:用RNeasy Plus Mini RNA提取试剂盒(Qiagen),提取300μL CVB3病毒液的总RNA,溶于30μL RNase Free H2O中,并将其反转录成cDNA。用引物VP1-F和VP1-R进行PCR,特异性扩增CVB3的VP1基因。20μL PCR反应体系为:ddH2O11.7μL、10×buffer 2μL、dNTP 2μL、VP1-F 1μL、VP1-R 1μL、Taq酶 0.3μL、cDNA 2μL。反应条件为:95℃预变性5min,95℃ 30s、54.4℃ 30s、72℃ 20s共30个循环,最后延伸72℃ 10min。
1.2.3重组质粒pMD18-T-VP1的构建。PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳后,切胶纯化回收目的片段VP1,用限制性内切酶BamHⅠ和XHOⅠ分别对VP1和PMD18-T载体进行酶切,酶切正确后胶回收,并将VP1目的片段和PMD18-T载体进行连接,10μL连接体系为pMD-18T载体1μL、PCR胶回收产物VP14μL、SolutionI 5μL,16℃连接过夜后,克隆至pMD-18T载体,构建PMD18-T/VP1重组质粒,将重组质粒转化E.coli DH5α感受态细胞,选取菌液PCR、酶切及测序正确(上海英骏生物技术有限公司)的阳性克隆。
1.2.4pEGX-VP1重组质粒的构建。用限制性内切酶BamH Ⅰ和XHOⅠ分别对PMD18-T/VP1重组质粒和pEGX-6P-1表达载体进行酶切,将酶切正确的VP1目的片段并将VP1目的片段和pEGX-6P-1原核表达载体16℃连接过夜后,克隆至pEGX-6P-1载体,构建6P-1/VP1原核表达质粒。转化后摇菌,PCR、酶切及测序正确(上海英骏生物技术有限公司)的阳性克隆即为需要的pEGX-VP1重组质粒。
1.2.5VP1蛋白的表达与纯化:将pEGX-VP1阳性克隆摇菌过夜,按1:100的比例接种于含有Ampicillin(100μg/mL)抗性的无菌LB液体培养基中,37℃摇菌扩增至OD值达到0.4时,加入IPTG使其终浓度为1.5mmol/L,37℃诱导5h。
1.2.6VP1蛋白的SDS-PAGE鉴定。将诱导表达的菌液,4℃离心4500r/min×10min,菌液沉淀用1/50体积的PBS悬起。超声破碎菌体,离心后分别得到全菌、上清和沉淀的蛋白样品,分别将上述蛋白样品按比例加入5×SDS Loading Buffer煮样,分别取样品进行SDS-PAGE电泳。80V缓慢电泳,使蛋白样品达到同一水平线上。待蛋白Marker条带分离明显后,以120 V电压电泳至溴酚兰行到达电泳槽下端。后将胶慢慢地拿起放入盛有考马斯亮蓝R250染色液的平皿中,室温下,旋转摇床上摇动染色1h左右,蛋白胶染好色后,将胶取出,用蒸馏水将蛋白胶冲洗2次,后放入盛有脱色液的平皿中,室温下,旋转摇床上摇动脱色1~2h,能清楚的看见蛋白条带时,可停止脱色,蛋白胶可用蒸馏水浸泡后在凝胶成像系统进行拍照。以鉴定VP1目的蛋白有无表达及目的蛋白的存在形式。 1.2.7VP1蛋白的Western blot鉴定。将获得的全菌、上清和沉淀的蛋白样品,分别取样品进行SDS-PAGE电泳后,将凝胶蛋白带电转移至硝酸纤维素膜上,脱脂乳37℃封闭2h。洗膜后按1∶2000稀释GST单抗,37℃孵育1h。洗膜后加HRP标记的山羊抗鼠IgG(1∶5000稀释),37℃孵育1h,洗涤,经ECL显色后扫膜。
2结果
2.1VP1基因的PCR扩增。1%琼脂糖凝胶电泳表明,用所合成的特异性引物VP1-F和VP1-R进行PCR扩增,在约702bp处有一特异性条带,与预期目的片段长度一致,测序结果表明其序列与GenBank公布的CVB3序列一致。
2.2PMD18-T/VP1重组质粒的鉴定。重组质粒PMD18-T/VP1菌液PCR和酶切后经琼脂糖电泳可见与预期大小相符的条带。菌液测序结果与目的片段序列一致性为100%。
2.3重组质粒pGEX-VP1的鉴定。重组质粒pGEX-VP1菌液PCR和酶切后经琼脂糖电泳在702bp处可见与预期大小相符的条带(图1)。菌液测序结果与目的片段序列一致率为100%。
2.4原核蛋白的诱导表达。经IPTG诱导的菌液超声破碎后分别用上清、沉淀进行SDS-PAGE,结果显示目的蛋白在沉淀中表达,说明目的蛋白是包涵体蛋白。包涵体蛋白分别用SDS-PAGE和Western-blot进行鉴定,结果显示在相对分子量约54kD处均可见目的条带,见图2。
3讨论
柯萨奇病毒属小RNA病毒科肠道病毒属,根据柯萨奇病毒对乳鼠的致病特点及对细胞敏感性的不同,将其分成A组和B组,其中B组病毒有6个血清型,即B1~B6。CVB3呈球形,直径约22~30nm,为单股正链RNA,全长由7400个碱基
组成,具有mRNA活性和感染性。RNA基因组由4个部分组成,依次为5′端非编码区、编码区、3′端非编码区和一个Poly(A)尾。P1区编码病毒的主要结构蛋白即衣壳蛋白,包括VP4(1A)、VP2(1B)、VP3(1C)和VP1(1D)4个蛋白产物。4个结构蛋白共同组成该病毒的衣壳,其中VP1、VP2以及VP3蛋白在病毒的表面形成了独特的峡谷样结构,因VPl蛋白是病毒与宿主细胞特异性受体相结合的部位,故病毒的吸附与VP1区密切相关。据流行病学调查显示,VP1在CVB3致病方面发挥重要作用,因为VP1不仅是中和病毒的决定因子,可以直接影响到病毒的抗原性,而且VP1基因具有与病毒血清型完全对应的遗传多样性,它既作为肠道病毒属内不同血清分型的依据,又可以作为小RNA病毒科内不同属的分类参考[2]。本研究构建了pGEX-VP1重组质粒,用原核表达系统成功表达了GST-VP1融合蛋白。
CVB3 VP1蛋白的成功制备为CVB3的进一步研究,特别是为CVB3 VP1蛋白的研究奠定了良好的基础,对临床诊断和实验室诊断具有重要意义。
参考文献
[1]Maghsoudi N, et al.Cloning and expression of coxsakievirus B3 viral protein21 in Ecoli[J].Iran Biomed J, 2007, 11(3): 147-152
[2]李哲等.科柯萨奇B3病毒VP1基因序列及系统发生树分析[J].中国老年学杂志,2007,27(02):234-236
摘要:目的:诱导表达柯萨奇B3病毒(CVB3)的VP1蛋白。
方法:针对CVB3基因的VP1区设计特异性引物,RT-PCR扩增VP1基因并将其克隆到pGEX-6p-1中,经IPTG诱导表达VP1蛋白。采用SDS-PAGE和Western blot检测VP1特异性蛋白的表达情况。
结果:SDS-PAG在相对分子量约54kD处可见目的条带,Western blot检测亦相对分子量约54kD处见到了清晰的蛋白条带。
结论:成功诱导表达了特异性较高的VP1蛋白。
关键词:柯萨奇B3病毒原核表达融合蛋白
【中图分类号】R4【文献标识码】A【文章编号】1671-8801(2013)11-0006-02
柯萨奇病毒B3(CVB3)属小RNA病毒科,肠道病毒属。流行病学调查显示,约50%的病毒性心肌炎与肠道病毒感染有关,特别是与CVB3的关系最为密切。同时,CVB3还会引起肝炎、胰腺炎和无菌性脑膜炎等疾病。近年来其发病呈上升趋势,但目前尚缺乏有效的防治措施。CVB3呈球形,直径约22~30nm,为单正链的RNA病毒,具有mRNA活性和感染性,全长为7397个核苷酸。依据其功能分,可分为5′端非编码区(5′-untranslated region,5′-UTR)、P1区、P2区、P3区、3′端非编码区(3′-UTR)和一个Poly(A)尾。P1区编码病毒的主要结构蛋白即衣壳蛋白,该区由VP1、VP2、VP3和VP4组成,其中VP1蛋白为病毒的主要中和抗原。病毒的主要中和抗原位点位于VP1上,VP4序列高度保守,但不暴露在衣壳的外面,故不具有中和性抗原位点[1]。本研究将VP1基因插入pEGX-6p-1表达载体中,构建了pEGX-VP1重组质粒,并诱导表达了GST-VP1融合蛋白,从而为建立CVB3的免疫生物分析方法奠定基础。
1材料与方法
1.1材料。
1.1.1主要材料:CVB3由哈尔滨医科大学病原微生物实验室钟照华教授馈赠。
1.1.2抗体和试剂:pMD18-T载体、限制性内切酶、ExTaq购自宝生物工程(大连)有限公司;原核表达载体pEGX-6p-1为本实验室保存;山羊抗鼠HRP-IgG均购自中杉金桥生物技术有限公司;感受态E.coli BL21(DE3)购自天根生化科技有限公司;其他常用化学试剂为国产或进口分析纯。
1.2方法。
1.2.1引物的设计与合成:采用Primer Express 2.0软件,根据CVB3的核苷酸序列,在VP1区设计特异性引物VP1-F:5’-ATGCAGACACGCCACGTTAAG-3’,酶切位点为:BamHⅠ;VP1-R:5’-CGTATTTGTCATTGTAGTGAT-3’,酶切位点为:XhoⅠ,用于扩增VP1基因(702bp)。引物由上海英骏生物技术有限公司合成。
1.2.2VP1基因的扩增:用RNeasy Plus Mini RNA提取试剂盒(Qiagen),提取300μL CVB3病毒液的总RNA,溶于30μL RNase Free H2O中,并将其反转录成cDNA。用引物VP1-F和VP1-R进行PCR,特异性扩增CVB3的VP1基因。20μL PCR反应体系为:ddH2O11.7μL、10×buffer 2μL、dNTP 2μL、VP1-F 1μL、VP1-R 1μL、Taq酶 0.3μL、cDNA 2μL。反应条件为:95℃预变性5min,95℃ 30s、54.4℃ 30s、72℃ 20s共30个循环,最后延伸72℃ 10min。
1.2.3重组质粒pMD18-T-VP1的构建。PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳后,切胶纯化回收目的片段VP1,用限制性内切酶BamHⅠ和XHOⅠ分别对VP1和PMD18-T载体进行酶切,酶切正确后胶回收,并将VP1目的片段和PMD18-T载体进行连接,10μL连接体系为pMD-18T载体1μL、PCR胶回收产物VP14μL、SolutionI 5μL,16℃连接过夜后,克隆至pMD-18T载体,构建PMD18-T/VP1重组质粒,将重组质粒转化E.coli DH5α感受态细胞,选取菌液PCR、酶切及测序正确(上海英骏生物技术有限公司)的阳性克隆。
1.2.4pEGX-VP1重组质粒的构建。用限制性内切酶BamH Ⅰ和XHOⅠ分别对PMD18-T/VP1重组质粒和pEGX-6P-1表达载体进行酶切,将酶切正确的VP1目的片段并将VP1目的片段和pEGX-6P-1原核表达载体16℃连接过夜后,克隆至pEGX-6P-1载体,构建6P-1/VP1原核表达质粒。转化后摇菌,PCR、酶切及测序正确(上海英骏生物技术有限公司)的阳性克隆即为需要的pEGX-VP1重组质粒。
1.2.5VP1蛋白的表达与纯化:将pEGX-VP1阳性克隆摇菌过夜,按1:100的比例接种于含有Ampicillin(100μg/mL)抗性的无菌LB液体培养基中,37℃摇菌扩增至OD值达到0.4时,加入IPTG使其终浓度为1.5mmol/L,37℃诱导5h。
1.2.6VP1蛋白的SDS-PAGE鉴定。将诱导表达的菌液,4℃离心4500r/min×10min,菌液沉淀用1/50体积的PBS悬起。超声破碎菌体,离心后分别得到全菌、上清和沉淀的蛋白样品,分别将上述蛋白样品按比例加入5×SDS Loading Buffer煮样,分别取样品进行SDS-PAGE电泳。80V缓慢电泳,使蛋白样品达到同一水平线上。待蛋白Marker条带分离明显后,以120 V电压电泳至溴酚兰行到达电泳槽下端。后将胶慢慢地拿起放入盛有考马斯亮蓝R250染色液的平皿中,室温下,旋转摇床上摇动染色1h左右,蛋白胶染好色后,将胶取出,用蒸馏水将蛋白胶冲洗2次,后放入盛有脱色液的平皿中,室温下,旋转摇床上摇动脱色1~2h,能清楚的看见蛋白条带时,可停止脱色,蛋白胶可用蒸馏水浸泡后在凝胶成像系统进行拍照。以鉴定VP1目的蛋白有无表达及目的蛋白的存在形式。 1.2.7VP1蛋白的Western blot鉴定。将获得的全菌、上清和沉淀的蛋白样品,分别取样品进行SDS-PAGE电泳后,将凝胶蛋白带电转移至硝酸纤维素膜上,脱脂乳37℃封闭2h。洗膜后按1∶2000稀释GST单抗,37℃孵育1h。洗膜后加HRP标记的山羊抗鼠IgG(1∶5000稀释),37℃孵育1h,洗涤,经ECL显色后扫膜。
2结果
2.1VP1基因的PCR扩增。1%琼脂糖凝胶电泳表明,用所合成的特异性引物VP1-F和VP1-R进行PCR扩增,在约702bp处有一特异性条带,与预期目的片段长度一致,测序结果表明其序列与GenBank公布的CVB3序列一致。
2.2PMD18-T/VP1重组质粒的鉴定。重组质粒PMD18-T/VP1菌液PCR和酶切后经琼脂糖电泳可见与预期大小相符的条带。菌液测序结果与目的片段序列一致性为100%。
2.3重组质粒pGEX-VP1的鉴定。重组质粒pGEX-VP1菌液PCR和酶切后经琼脂糖电泳在702bp处可见与预期大小相符的条带(图1)。菌液测序结果与目的片段序列一致率为100%。
2.4原核蛋白的诱导表达。经IPTG诱导的菌液超声破碎后分别用上清、沉淀进行SDS-PAGE,结果显示目的蛋白在沉淀中表达,说明目的蛋白是包涵体蛋白。包涵体蛋白分别用SDS-PAGE和Western-blot进行鉴定,结果显示在相对分子量约54kD处均可见目的条带,见图2。
3讨论
柯萨奇病毒属小RNA病毒科肠道病毒属,根据柯萨奇病毒对乳鼠的致病特点及对细胞敏感性的不同,将其分成A组和B组,其中B组病毒有6个血清型,即B1~B6。CVB3呈球形,直径约22~30nm,为单股正链RNA,全长由7400个碱基
组成,具有mRNA活性和感染性。RNA基因组由4个部分组成,依次为5′端非编码区、编码区、3′端非编码区和一个Poly(A)尾。P1区编码病毒的主要结构蛋白即衣壳蛋白,包括VP4(1A)、VP2(1B)、VP3(1C)和VP1(1D)4个蛋白产物。4个结构蛋白共同组成该病毒的衣壳,其中VP1、VP2以及VP3蛋白在病毒的表面形成了独特的峡谷样结构,因VPl蛋白是病毒与宿主细胞特异性受体相结合的部位,故病毒的吸附与VP1区密切相关。据流行病学调查显示,VP1在CVB3致病方面发挥重要作用,因为VP1不仅是中和病毒的决定因子,可以直接影响到病毒的抗原性,而且VP1基因具有与病毒血清型完全对应的遗传多样性,它既作为肠道病毒属内不同血清分型的依据,又可以作为小RNA病毒科内不同属的分类参考[2]。本研究构建了pGEX-VP1重组质粒,用原核表达系统成功表达了GST-VP1融合蛋白。
CVB3 VP1蛋白的成功制备为CVB3的进一步研究,特别是为CVB3 VP1蛋白的研究奠定了良好的基础,对临床诊断和实验室诊断具有重要意义。
参考文献
[1]Maghsoudi N, et al.Cloning and expression of coxsakievirus B3 viral protein21 in Ecoli[J].Iran Biomed J, 2007, 11(3): 147-152
[2]李哲等.科柯萨奇B3病毒VP1基因序列及系统发生树分析[J].中国老年学杂志,2007,27(02):234-236