【摘 要】
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目的 建立新型冠状病毒(SARS-CoV-2)亚基因组RNA (sgRNAs)荧光重组酶介导等温扩增(reverse-transcription recombinase-aided amplification,RT-RAA)检测方法。方法 根据SARS-CoV-2的5’-leader和7a基因序列设计特异性等温扩增引物和探针,在39℃等温条件下,30 min内对SARS-CoV-2的sgRNAs进
【机 构】
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江苏省疾病预防控制中心病原微生物研究所
【基金项目】
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江苏省自然科学基金(BK20191489),BK20211373); 江苏省六大人才高峰项目(WSN-024); 江苏省卫健委重点科研项目(ZD2021060);
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目的 建立新型冠状病毒(SARS-CoV-2)亚基因组RNA (sgRNAs)荧光重组酶介导等温扩增(reverse-transcription recombinase-aided amplification,RT-RAA)检测方法。方法 根据SARS-CoV-2的5’-leader和7a基因序列设计特异性等温扩增引物和探针,在39℃等温条件下,30 min内对SARS-CoV-2的sgRNAs进行快速检测,并对该方法的敏感性、特异性及与实时荧光定量PCR (real-time fluorescence quantitative PCR,real time PCR)法的一致性进行了评价。结果 该方法检测限可达到20拷贝/μL,且与其他呼吸道病原体均无交叉反应,具有良好的敏感性和特异性;与real time PCR法相比,两种检测方法一致性较好(κ=0.762,P<0.001)。结论 本文建立的荧光RT-RAA法可用于SARS-CoV-2 sgRNAs的快速检测,对于临床样本感染性的快速诊断有重要意义。
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