【摘 要】
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将预测的籼稻基因同289个已知的拟南芥细胞色素P450基因进行蛋白质序列比对,在籼稻(Oryza sativa L.ssp.indica)工作框架草图中找到了528个可能的细胞色素P450基因,初步认定
【机 构】
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北京大学生命科学院; 中国科学院基因组信息学中心暨华大基因研究中心; 中国科学院基因组信息学中心暨华大基因研究中心 北京100871 中国科学院基因组信息学中心暨华大基因研究中心
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将预测的籼稻基因同289个已知的拟南芥细胞色素P450基因进行蛋白质序列比对,在籼稻(Oryza sativa L.ssp.indica)工作框架草图中找到了528个可能的细胞色素P450基因,初步认定上述籼稻P450基因来自于已在拟南芥中确定的40个P450基因家族.比较拟南芥和籼稻的细胞色素P450s在基因家族中的分布,发现这两种植物P450基因的家族分布规律总体相似,但也有不同,例如:CYP71,CYP72,CYP76,CYP89,CYP94,CYP709等家族的成员在籼稻中远远多于拟南芥的;CYP705家族的成员在籼稻中没有,但在拟南芥中却多达33个.另外,发现籼稻CYP71和CYP81家族的成员在基因组中成串联重复排列,它们可能是进化过程中基因复制的结果.进一步将这些籼稻P450基因的DNA序列同籼稻表达序列标签(expression sequence tags,ESTs)进行核酸序列比对,为263个可能的籼稻P450s找到了ESTs的证据,说明这些基因在转录水平上确实有所表达.
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