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蛋白质是一类重要的生物大分子,在生物体内占有特殊的地位,是生命的主要承担者。而研究蛋白质的折叠,是生命科学领域的前沿课题之一。在概述蚁群算法及2D HP蛋白质模型的基础上,针对蛋白质折叠问题提出一种蚁群优化算法,并用几个比较典型的模型对其进行仿真实验,结果表明该蚁群优化算法在求解蛋白质折叠问题时表现出了良好的性能。实践表明该算法具有很高的应用价值。